24小时热门版块排行榜    

查看: 2592  |  回复: 9
【悬赏金币】回答本帖问题,作者爱吃旺旺碎冰冰将赠送您 15 个金币

爱吃旺旺碎冰冰

新虫 (小有名气)

[求助] 目的基因片段总是装载不上pMD18-T载体上,求助!!! 已有1人参与

一、用高保真酶、设计的引物对细菌DNA进行PCR扩增(50μL体系共三管),电泳后发现条带单一且无杂带
二、PCR产物纯化
三、将胶回收的DNA片段加A尾:
1.胶回收提取液与Taq酶预混物1:1混合,各为25μL(共50μL)
2.72℃退火30min
3.PCR产物纯化【纯化过程中的第二步:2.估计PCR反应液或酶切反应液的体积,向其中加入等倍体积溶液PC(此步加入30μLPC,实际上上一步PCR反应液为50μL,但误以为是30μL,所以加了30μL溶液PC与50μLPCR反应液混合均匀后就加入吸附柱中了,加完后发现加错了,又向吸附住中补加了20uL)】
四、将pMD18-T载体与已纯化的目的片段相连接:
1.1μLpMD18-T载体、5μL连接缓冲液SolutionⅠ、4μL已纯化的PCR产物加入到一个新的PCR管中混匀
2.将其放入金属浴连接槽中16℃恒温过夜,本次连接时间共计17h左右
3.将样品取出冰箱4℃保存。
五、将质粒转入感受态细胞(CaCl2转化法):
1.从-80℃冰箱中取出一管制备好的感受态细胞Top10(100μL),立即置于冰水混合物上,将10μL制备好的质粒加入感受态细胞中,轻轻吹打混匀,将混合物置于冰水混合物中静置30min
2.将其放在42℃水浴锅中热激90s
3.将其取出再置于冰水混合物中5min,然后加入1mL新鲜LB液体培养基中,37℃,200rpm,培养1h。
六、涂平板及培养:
1.制备两个氨苄抗性平板:向60mLLB固体培养基(不烫手即可)中按照1:1000的比例加入60μL氨苄抗性(原液浓度100mg/mL),轻晃混匀,倒两个平板,静止凝固
2.先吸取100μL菌液均匀涂布在氨苄抗性平板上,剩余900μL菌液11000rpm离心1min,弃去800μL上清液,剩余100μL菌液重悬,均匀涂布在另一个氨苄抗性平板上;37℃过夜培养,本次共计培养20h左右
七、挑菌落及培养:挑取平板上的单菌落(共七个)分别接种到新鲜LB液体培养基中,37℃,200rpm,过夜培养,由于操作失误,导致前20h无振荡培养,发现菌液浑浊度较低,又200rpm振荡培养了4哈,共计24h
八、菌液PCR:用Taq酶、设计的引物、菌液分别作模版进行PCR九、电泳:结果七种阳性菌液都显示有目的条带
九、任意选取一瓶菌液吸取1.5mL提取质粒:质粒小提试剂盒
十、双酶切验证目的基因片段是否成功装载上pMD18-T载体上:
1.(20uL体系)质粒10u、10xbuffer2u、Pst1 0.5u、Sac1 0.5u、ddH2O7u混合;38摄氏度恒温培养箱温育1h10min;
2.电泳:结果显示无条带
这是我用这种方法(试剂的用量、步骤都一样)将目的片段装载到T载体的第三次实验了,前两次用的引物不是设计的引物,而是从文献中筛选到的引物,目的是想通过装载T载体上,测序出目的片段两端的未知序列,但通过测序结果都显示空载,都没有成功装载了,后面通过全基因比对出了目的片段的两端序列,即从全基因中找出了目的基因的完整序列,之后又通过软件重新设计引物(可以扩增出完整目的片段),然后就做了上述步骤,只不过没有测序,而是通过双酶切检验是否成功装载到T载体上,还是没有装载上。
拜托大佬请教一下几个问题:
1.做了这三次实验最后菌液PCR电泳后都显示有目的条带,前两次有一次还做了质粒PCR电泳后也显示有条带啊,但是就是进一步验证测序显示空载,包括这次双酶切电电泳后显示无条带,我想知道这是哪里出问题了?电泳验证都显示有条带,但最后进一步验证还是空载,那电泳显示有条带是咋回事?难道电泳这么不靠谱吗?难道以后我都要再测序或者双酶切进一步验证吗?
2.哪些具体步骤可能导致我一直装载不上T载体?
3.我该如何优化实验让目的片段成功装载到T载体上呢?
4.以上步骤所有用到的酶,我都是从冰箱里拿出来,也没有放在冰上加,直接放在离心管架上加的,这会对最终实验结果有影响吗?
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Andy_124

禁虫 (著名写手)

本帖内容被屏蔽

2楼2024-12-06 16:34:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Andy_124

禁虫 (著名写手)

本帖内容被屏蔽

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

3楼2024-12-06 16:36:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chen5805

至尊木虫 (职业作家)

资深木虫

1.一般情况下目的基因连接T载体很容易成功的;2.做菌液PCR,用扩增目的基因的引物扩增完,产物电泳检测,挑选阳性菌液送sanger测序,一般没问题;3.你的菌液PCR是假阳性,有可能是你没连接上T载体,也有可能是你重组质粒转化感受态细胞有问题;

发自小木虫手机客户端

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

4楼2024-12-06 18:18:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

爱吃旺旺碎冰冰

新虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by chen5805 at 2024-12-06 18:18:44
1.一般情况下目的基因连接T载体很容易成功的;2.做菌液PCR,用扩增目的基因的引物扩增完,产物电泳检测,挑选阳性菌液送sanger测序,一般没问题;3.你的菌液PCR是假阳性,有可能是你没连接上T载体,也有可能是你重组 ...

那我需要怎样优化一下呢?问了老师说也不知道到底是哪里的问题导致一直连接不成功

发自小木虫IOS客户端
5楼2024-12-09 23:58:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

爱吃旺旺碎冰冰

新虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
3楼: Originally posted by Andy_124 at 2024-12-06 16:36:09
你用Taq酶其实就不用加A尾的

但刚开始用的是高保真酶扩的,扩完后加A尾的,一直连接不上,唉,连三次了都不成功

发自小木虫IOS客户端
6楼2024-12-10 00:02:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

strongFv

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

1.菌P可能会存在假阳性,可以用专门去了背景的专用酶进行鉴定,比如擎科的菌P专家(TSE005)
4.PMD系列载体是要在冰上加最好,擎科的T载是要常温加的,各家要求不太一样,多多少少会有影响。不确定哪里出问题的话,最好还是按照说明书严格操作。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

7楼2024-12-10 16:41:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

爱吃旺旺碎冰冰

新虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
7楼: Originally posted by strongFv at 2024-12-10 16:41:53
1.菌P可能会存在假阳性,可以用专门去了背景的专用酶进行鉴定,比如擎科的菌P专家(TSE005)
4.PMD系列载体是要在冰上加最好,擎科的T载是要常温加的,各家要求不太一样,多多少少会有影响。不确定哪里出问题的话, ...

好的,等我查查说明书,我再试试,我总觉得是加样体系体积那方面的问题

发自小木虫IOS客户端
8楼2024-12-11 14:46:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

库洛米酱

新虫 (初入文坛)

我跟你情况很像!!你的T载是那个牌子的,我用的takara连接时间用不了这么久,但跟你的连接体系一样。

发自小木虫IOS客户端
9楼2024-12-16 11:21:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

shuaibia6

金虫 (小有名气)

小白做不出的话建议直接丢给外面的公司做
10楼2025-01-26 10:16:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 爱吃旺旺碎冰冰 的主题更新
不应助 确定回帖应助 (注意:应助才可能被奖励,但不允许灌水,必须填写15个字符以上)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 26考研求调剂 +5 丶宏Sir 2026-03-13 5/250 2026-03-13 13:05 by JourneyLucky
[考研] 0703一志愿211 285分求调剂 +4 ly3471z 2026-03-13 4/200 2026-03-13 13:00 by JourneyLucky
[考研] 0817化学工程与技术考研312分调剂 +3 T123 tt 2026-03-12 3/150 2026-03-13 10:49 by houyaoxu
[考研] 282分材料专业求调剂院校 +18 枫桥ZL 2026-03-09 25/1250 2026-03-13 10:47 by 白夜悠长
[考研] 274求调剂0856材料化工 +12 z2839474511 2026-03-11 13/650 2026-03-13 10:39 by peike
[考研] 求材料调剂 +3 隔壁陈先生 2026-03-12 3/150 2026-03-13 10:20 by 学员8dgXkO
[考研] 290求调剂 +3 ADT 2026-03-13 3/150 2026-03-13 10:19 by peike
[文学芳草园] 伙伴们,祝我生日快乐吧 +12 myrtle 2026-03-10 14/700 2026-03-13 10:16 by Equinoxhua
[考研] 337一志愿华南理工0805材料求调剂 +6 mysdl 2026-03-11 8/400 2026-03-12 17:19 by 松花缸1201
[考研] 290求调剂 +3 柯淮然 2026-03-10 8/400 2026-03-11 13:48 by 柯淮然
[考研] 求调剂 +4 鹤遨予卿 2026-03-09 4/200 2026-03-11 10:47 by @飒飒飒飒
[考研] 0856材料与化工353分求调剂 +11 NIFFFfff 2026-03-09 11/550 2026-03-10 18:36 by suyuanhai
[考研] 327分求调剂086 +4 西红柿?小帅 2026-03-09 7/350 2026-03-10 14:47 by ruiyingmiao
[考研] 334求调剂 +5 Trying] 2026-03-07 5/250 2026-03-09 14:47 by ruiyingmiao
[考研] 考研求调剂,工科,总分304 +4 矮子不想长高了 2026-03-08 7/350 2026-03-08 22:21 by 小木虫tim
[考研] 调剂 +3 13853210211 2026-03-08 3/150 2026-03-08 19:34 by ms629
[考研] 材料科学(0805)338 求调剂 +7 xiaokang3286 2026-03-07 7/350 2026-03-08 03:42 by lfhuang
[考研] 346分材料求调剂 +5 snow_反季节版 2026-03-07 5/250 2026-03-07 22:40 by Leeding1356
[考研] 0307化学求调剂 +6 0ok0k 2026-03-07 6/300 2026-03-07 20:10 by pies112
[考研] 一志愿中国石油大学(华东) 本科齐鲁工业大学 求调剂 +3 snw石 2026-03-07 3/150 2026-03-07 20:01 by houyaoxu
信息提示
请填处理意见