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子不语1977

新虫 (小有名气)

[求助] Crispr敲除拟南芥能在Basta筛选下长出来但是靶点未被编辑

遇到的问题如题
使用的拟南芥是一个OE株系(Hyg抗性),一个双突株系(无抗性),在这两个基础上分别转入带Basta抗性的crispr质粒敲除基因。crispr质粒是刘耀光院士实验室的PYLCRISPR/Cas9 Pubi-B质粒。通过浸花法得到的种子差不多每一两万颗出一颗能在Basta筛选下生长的阳性苗。跑设计在靶点附近上下游300bp引物获得的PCR产物经过测序发现靶点未被编辑。同时再用Basta筛选下生长的阳性苗提的DNA去跑Cas9-F/R,有很弱的条带,如图(将Cas9-F/R引物输入UB质粒图谱,对应产物大小为572bp)

请问我该如何解决靶点未被编辑的这个问题
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