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Full_light

新虫 (小有名气)


[交流] 想问问uu们,物质质子化前后能量变化怎么计算?

就比如含两个氮原子的芳香杂环化合物(例如吡嗪),怎么计算质子化前、一个氮原子质子化、两个氮原子质子化的能量变化呢?
我还是新手,之前没啥计算实操,希望大佬在介绍一下使用的软件
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chenhuanlong

禁虫 (文学泰斗)


Full_light(金币+2): 谢谢参与
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5楼2024-07-17 11:20:08
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Full_light(金币+2): 谢谢参与
计算一个过程的能量变化比如说 A+B--> C过程 要把A 和 B和C分别优化出来得到能量之后用C的能量减去A和B的能量就可以了。 这种用高斯就可以了。
那对于质子化的过程就是类似于这种的过程。
质子化前的能量和质子化后的分子的能量通过量化计算算出来先。然后还需要知道质子的能量 才可以算出这个过程的能量。 这个通过计算得不到质子的热力学量 (质子自己的电子能是0)  需要查文献   比如这些文献给出了 质子在气相里的能量 J  Phys.Chem.A.118.11090 (2014)、J. Chem. Theory Comput..9. 3165(2013)。298K,1atm气相下: 质子的自由能和焓分别是
G(H+)=-26.3101 kJ/mol   H(H+)=6.1394 kJ/mol  溶剂里的话还需要加上溶解自由能这个可以看这个文献  J. Phys. Chem. B, 110, 16066 (2006),数值是-265.9 kcal/mol
14楼2024-07-17 16:56:52
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hyjcs4楼
2024-07-17 11:19   回复  
Full_light(金币+2): 谢谢参与
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MicroShop9楼
2024-07-17 13:03   回复  
Full_light(金币+2): 谢谢参与
222 发自小木虫Android客户端
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