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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 【求助】关于同源模建
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syfnet

新虫 (初入文坛)

[交流] 【求助】关于同源模建

请问一下蛋白质同源模建的软件都有哪些免费的？

我用swiss-model网站来构建同源蛋白质结构，这个准确吗？

[ Last edited by lei0736 on 2009-11-24 at 21:58 ]
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1楼 2009-10-25 16:41:53
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syfnet

新虫 (初入文坛)
我用的蛋白相似性很高>80％，但我想基于两个结构建模，这样的话好像moe不行吧。在ds下可以实现吗？

另外，说明书上都是基于互联网搜索相似结构，而我自己手头有蛋白结构，不用搜索，怎么输入到ds进行建模

[ Last edited by syfnet on 2009-11-2 at 16:04 ]
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6楼2009-11-02 15:49:49
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子陵263

木虫 (正式写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢 10-27 17:29
autodock 免费 可以用这个
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2楼2009-10-27 17:07:41
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syfnet

新虫 (初入文坛)
★
yjcmwgk(金币+1,VIP+0): 10-30 08:56
引用回帖:
Originally posted by 子陵263 at 2009-10-27 17:07:
autodock 免费 可以用这个

autodock我正在用，没有同源模建的功能吧。
赞一下(10人) 回复此楼
3楼2009-10-28 09:44:07
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tjegg

铁杆木虫 (著名写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
yjcmwgk(金币+1,VIP+0): 10-30 08:56
你可以先用BLAST查询他的同源蛋白的相似性有多少，越高越准。
赞一下(11人) 回复此楼
除了你的亲人，没有人应该对你好，对你好的人，一定要珍惜。
4楼2009-10-30 07:09:42
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