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kinpri

新虫 (初入文坛)

[求助] 求助,通过CRISPR在内源性基因后边插入GFP 已有1人参与

目的是想内源性基因终止密码子前插入GFP,让GFP和目的基因一起表达
我使用的gRNA质粒是lentiCRISPR-v2,设计了两个gRNA,把两个gRNA中间的序列完全敲除,PAM序列在切除的这一段序列中,所以没有做donor的点突变
donor质粒是pEASY blunt simple cloning kit,选取了两个gRNA左右侧各800bpDNA序列,两端DNA序列中间是P2A-GFP,通过重叠PCR将三个片段P到一起后直接和线性化的载体相连
构好质粒后用lipo3000转染
现在的情况是我师姐也在做这个实验,但是和我用的细胞不一样,她的情况是gRNA位点发生了突变,但没用donor做模板进行修复
我用的是胚胎干,但一直没转进去,所以现在想先换个细胞试下效果,看能不能成功插入GFP,如果能成功再用胚胎干做
有没有大佬知道问题出在哪里

求助,通过CRISPR在内源性基因后边插入GFP
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fjgcwrn

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
不建议双点进行切割,如果你的P2A-GFP插入位置选在最后一个外显子的后面,双sgRNA切割掉的内含子区域为pre-mRNA进行内含子切割的识别序列可能导致最后一个外显子无法正确形成mRNA。当然这是成功Donor进去之后考虑的事情。
现在首要的目的先去检测你两个sgRNA是否发生一定概率的切割,即使切开,Donor依然存在概率。当然你没切开,肯定Donor不进去。
2楼2024-06-21 15:06:58
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