24小时热门版块排行榜    

查看: 789  |  回复: 8
当前主题已经存档。
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

lijianghua2007

荣誉版主 (职业作家)

[交流] check cif 中出现 A , B类错误

Alert level A
PLAT430_ALERT_2_A Short Inter D...A Contact  O2     ..  S5      ..       1.69 Ang.
PLAT430_ALERT_2_A Short Inter D...A Contact  O2'    ..  S5      ..       1.53 Ang.
--------------------------------------------------------------------------------
Alert level B
PLAT201_ALERT_2_B Isotropic non-H Atoms in Main Residue(s) .......          2      
PLAT432_ALERT_2_B Short Inter X...Y Contact  O2     ..  C6      ..       2.83 Ang.
PLAT432_ALERT_2_B Short Inter X...Y Contact  O2'    ..  C5      ..       2.73 Ang.
--------------------------------------------------------------------------------
请问:
Short Inter D...A Contact  和Isotropic non-H Atoms in Main Residue(s)  什么意思?
Short Inter D...A Contact和Short Inter X...Y Contact 有什么区别?
如何解决上面这些A,B错误?


[ Last edited by lijianghua2007 on 2009-10-17 at 15:01 ]
回复此楼
淡泊名利,宁静致远。
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

腾龙云飞

金虫 (著名写手)

★ ★ ★
lijianghua2007(金币+2,VIP+0):谢谢云飞兄,里面有二甲亚砜,像这样的无序怎么处理? 10-17 20:35
eeqeeq0002(金币+1,VIP+0):谢谢参与 10-20 19:20
楼上正解
都是由于O2的无序造成的
但行好事 莫问前程 _______ 渤海之滨 黄河之津 书生侠骨 义薄惊云
3楼2009-10-17 16:43:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 9 个回答

hcht2006

银虫 (正式写手)

★ ★ ★
lijianghua2007(金币+2,VIP+0):谢谢你,那无序怎么处理呢? 10-17 20:34
eeqeeq0002(金币+1,VIP+0):谢谢参与 10-20 19:20
Short Inter D...A Contact    是指氢键的给予者和接受者之间距离太小

Short Inter X...Y Contact   是指2原子之间距离太小

我估计主要原因是你的无序造成的,你再看看是否有无序,无序的处理是否正确。
世人笑我太疯癫,我笑他人看不穿。
2楼2009-10-17 16:02:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fmopily

铁杆木虫 (正式写手)

是的,确实都由于O2的无序造成的
5楼2009-10-17 21:11:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lijianghua2007

荣誉版主 (职业作家)

请问用什么命令消除这样的无序呢!
淡泊名利,宁静致远。
6楼2009-10-18 19:07:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
信息提示
请填处理意见