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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » CIF专栏 » check cif 中出现 A , B类错误
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lijianghua2007

荣誉版主 (职业作家)

[交流] check cif 中出现 A , B类错误

Alert level A
PLAT430_ALERT_2_A Short Inter D...A Contact  O2     ..  S5      ..       1.69 Ang.
PLAT430_ALERT_2_A Short Inter D...A Contact  O2'    ..  S5      ..       1.53 Ang.
--------------------------------------------------------------------------------
Alert level B
PLAT201_ALERT_2_B Isotropic non-H Atoms in Main Residue(s) .......          2      
PLAT432_ALERT_2_B Short Inter X...Y Contact  O2     ..  C6      ..       2.83 Ang.
PLAT432_ALERT_2_B Short Inter X...Y Contact  O2'    ..  C5      ..       2.73 Ang.
--------------------------------------------------------------------------------
请问：
Short Inter D...A Contact  和Isotropic non-H Atoms in Main Residue(s)  什么意思？
Short Inter D...A Contact和Short Inter X...Y Contact 有什么区别？
如何解决上面这些A，B错误？

[ Last edited by lijianghua2007 on 2009-10-17 at 15:01 ]
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淡泊名利，宁静致远。
1楼 2009-10-17 15:00:18
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hcht2006

银虫 (正式写手)
★ ★ ★
lijianghua2007(金币+2,VIP+0):谢谢你，那无序怎么处理呢？ 10-17 20:34
eeqeeq0002(金币+1,VIP+0):谢谢参与 10-20 19:20
Short Inter D...A Contact    是指氢键的给予者和接受者之间距离太小

Short Inter X...Y Contact   是指2原子之间距离太小

我估计主要原因是你的无序造成的，你再看看是否有无序，无序的处理是否正确。
赞一下(12人) 回复此楼
世人笑我太疯癫，我笑他人看不穿。
2楼2009-10-17 16:02:31
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腾龙云飞

金虫 (著名写手)
★ ★ ★
lijianghua2007(金币+2,VIP+0):谢谢云飞兄，里面有二甲亚砜，像这样的无序怎么处理？ 10-17 20:35
eeqeeq0002(金币+1,VIP+0):谢谢参与 10-20 19:20
楼上正解
都是由于O2的无序造成的
赞一下(12人) 回复此楼
但行好事 莫问前程 _______ 渤海之滨 黄河之津 书生侠骨 义薄惊云
3楼2009-10-17 16:43:13
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lijianghua2007

荣誉版主 (职业作家)
4楼2009-10-17 20:45:47
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fmopily

铁杆木虫 (正式写手)
是的，确实都由于O2的无序造成的
赞一下 回复此楼
5楼2009-10-17 21:11:02
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lijianghua2007

荣誉版主 (职业作家)
请问用什么命令消除这样的无序呢！
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淡泊名利，宁静致远。
6楼2009-10-18 19:07:04
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xi2004

至尊木虫 (职业作家)
★
eeqeeq0002(金币+1,VIP+0):谢谢参与 10-20 19:20
无序是一种客观存在, 要让其合理化, 而不是消除.
赞一下(10人) 回复此楼
xi2004-emuch@163.com
7楼2009-10-18 21:29:57
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zhousm

木虫 (正式写手)
经典啊！
引用回帖:
Originally posted by xi2004 at  10/18/09 21:29:
无序是一种客观存在, 要让其合理化, 而不是消除.

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8楼2009-10-19 12:08:39
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lijianghua2007

荣誉版主 (职业作家)
引用回帖:
Originally posted by xi2004 at 2009-10-18 21:29:
无序是一种客观存在, 要让其合理化, 而不是消除.

哦，受益匪浅！
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淡泊名利，宁静致远。
9楼2009-10-20 15:55:23
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