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VMD生成的石墨烯pbd文件如何正确转化为psf 已有1人参与
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在VMD中使用工具可以得到石墨烯,通过保存坐标可以轻松得到pdb文件。但是psf文件怎么得到呢? 我试了VMD的autopsf工具,会自动闪退,没办法得到psf。 然后我在Tcl中,使用一下命令可以得到psf package require topotools topo retypebonds topo guessangles topo guessdihedrals mol reanalyze 0 animate write psf name.psf 生成的psf看起来都没有问题,但是在仿真时候会报错,"FATAL ERROR: UNABLE TO FIND ANGLE PARAMETERS FOR C C C." 有没有大神知道如何得到正确的psf,十分感谢 @smutao @oxox6085 发自小木虫Android客户端 |
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