| 查看: 499 | 回复: 4 | ||
| 当前主题已经存档。 | ||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | ||
shuhua759捐助贵宾 (著名写手)
|
[交流]
链霉菌基因组分析
|
|
|
各位大侠好： 实验室最近通过基因组扫描的方法得到了一株链霉菌基因组序列，老板让我从中把硫酸转移酶（sulfotransferase）的序列找出来，小弟以前没怎么接触生物信息学方面的知识，知识简单的使用过Blast，但是，现在这个基因组序列太大了，word文件可是有5000多页呢，所以，小弟在这里求各路大侠给小弟出出主意，谢谢了！ |
回复此楼
cnlics
木虫 (小有名气)
- 应助: 2 (幼儿园)
- 金币: 3014.2
- 红花: 4
- 帖子: 270
- 在线: 422.4小时
- 虫号: 795158
- 注册: 2009-06-16
- 性别: GG
- 专业: 当代宗教
5楼2009-10-13 10:42:50
qgaoamtf
至尊木虫 (职业作家)
- 应助: 17 (小学生)
- 金币: 13397.4
- 散金: 1937
- 红花: 5
- 帖子: 4119
- 在线: 903.4小时
- 虫号: 447303
- 注册: 2007-10-31
- 性别: GG
- 专业: 微生物遗传育种学
2楼2009-10-11 21:33:02
cnlics
木虫 (小有名气)
- 应助: 2 (幼儿园)
- 金币: 3014.2
- 红花: 4
- 帖子: 270
- 在线: 422.4小时
- 虫号: 795158
- 注册: 2009-06-16
- 性别: GG
- 专业: 当代宗教
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
amisking(金币+5,VIP+0): 10-12 08:16
amisking(金币+5,VIP+0):gu li xin chong ! 10-12 08:17
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
amisking(金币+5,VIP+0): 10-12 08:16
amisking(金币+5,VIP+0):gu li xin chong ! 10-12 08:17
|
“通过基因组扫描的方法得到了一株链霉菌基因组序列”这话比较难以理解。一般来说，基因组扫描和基因组测序有很大的差别。 再者，用word处理DNA序列，你的风格真独特，但绝对不是个好方法。 你应该先将序列文件保存为txt格式，并导入一个序列管理软件，如Artemis，VectorNTI等，如果序列是你们自己测的并且注释了，你就可以直接搜索到你要的基因；如果是别人测序、注释的，你直接在网上搜索你要的基因即可。（http://www.ncbi.nlm.nih.gov/） |
3楼2009-10-12 00:43:44
shuhua759
捐助贵宾 (著名写手)
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 6044.2
- 散金: 1
- 红花: 4
- 帖子: 1181
- 在线: 594.8小时
- 虫号: 504959
- 注册: 2008-02-16
- 专业: 微生物生理与生物化学
4楼2009-10-13 09:03:08
50