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一步一步

木虫 (著名写手)

[交流] 【求助】关于药物设计中的蛋白质模型

请教各位高手:

我做药物设计用的蛋白质模型缺少C-末端和N-末端共62个氨基酸。原因是C-末端和N-末端的这62个氨基酸对小分子的结合作用贡献较小。

我的问题是:在我做分子对接时,我需不需要将这62个氨基酸补上??如果需要补的话,应该用什么工具??


希望各位多给些建议,不胜感激!!!!!!

[ Last edited by lei0736 on 2009-11-24 at 20:58 ]
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winterose_

铜虫 (小有名气)

★ ★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 10-10 12:41
一步一步(金币+1,VIP+0): 10-10 15:18
嗯,同意楼上.如果LZ不打算用考虑蛋白柔性的软件,就不用管了.
62个氨基酸还是蛮多的呀,应该需要一些数据构建骨架才能补上,sybyl应该不太可以胜任,LZ还是找些专业的做这方面的软件比较好.
4楼2009-10-10 12:36:52
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js.ao

银虫 (正式写手)


一步一步(金币+1,VIP+0): 10-10 15:19
帮LZ顶一下,是计算的问题的话可以帮忙!
爱是一道光,如此美妙
2楼2009-10-10 11:26:11
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yalefield

金虫 (文坛精英)

老汉一枚

★ ★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 10-10 12:28
一步一步(金币+1,VIP+0): 10-10 15:18
既然作用小,就不用补咯
3楼2009-10-10 11:44:18
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gwdavid

木虫 (著名写手)

小木虫散兵坑坑长

★ ★
yjcmwgk(金币+1,VIP+0): 10-10 13:35
一步一步(金币+1,VIP+0): 10-10 15:18
末端残基不用补的,一是其贡献不大;二是补上之后也优化不好,因其柔性较大
个人博客:[url]http://blog.sina.com.cn/gaiwei[/url]
5楼2009-10-10 12:42:39
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