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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 重测序可以知道某个基因的序列吗
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wdmzdywe

新虫 (初入文坛)
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重测序可以知道某个基因的序列吗
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重测序的结果为SNP、拷贝数变异、结构变异，既然我都测了全基因组了，那我可不可以在测序结果中得到某一基因的序列呢，这样我就不要扩基因测序了

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1楼 2023-06-22 04:21:42
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AD_com

金虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
当然可以，看你测序深度和基因组大小，理论上现在重测序都十几几十倍，所以理论上是可以组装基因组的，不过还有一个问题就是二代测序序列短，拼接肯定困难。可以用一个参考基因组做mapping试试，不过这种准确度不好，还是要简单的测序验证一下
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13楼2023-06-26 08:50:13
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wdmzdywe

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
13楼: Originally posted by AD_com at 2023-06-26 08:50:13
当然可以，看你测序深度和基因组大小，理论上现在重测序都十几几十倍，所以理论上是可以组装基因组的，不过还有一个问题就是二代测序序列短，拼接肯定困难。可以用一个参考基因组做mapping试试，不过这种准确度不好 ...

谢谢！

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14楼2023-06-28 00:31:45
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bluesky999910楼
2023-06-22 08:24   回复  
wdmzdywe(金币+2): 谢谢参与
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wyj9702楼
2023-06-22 05:12   回复  
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bodygb6楼
2023-06-22 06:23   回复  
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云在青天9楼
2023-06-22 07:53   回复  
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nono20093楼
2023-06-22 05:38   回复  
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xn80088楼
2023-06-22 07:31   回复  
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tzynew5楼
2023-06-22 06:00   回复  
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XG-WUST4楼
2023-06-22 05:54   回复  
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psh198902197楼
2023-06-22 06:48   回复  
wdmzdywe(金币+2): 谢谢参与
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一点也不简单11楼
2023-06-22 09:04   回复  
wdmzdywe(金币+1): 谢谢参与
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白羊line8212楼
2023-06-22 09:12   回复  
wdmzdywe(金币+2): 谢谢参与
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