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重测序可以知道某个基因的序列吗
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wdmzdywe
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重测序可以知道某个基因的序列吗
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重测序的结果为SNP、拷贝数变异、结构变异,既然我都测了全基因组了,那我可不可以在测序结果中得到某一基因的序列呢,这样我就不要扩基因测序了
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当然可以,看你测序深度和基因组大小,理论上现在重测序都十几几十倍,所以理论上是可以组装基因组的,不过还有一个问题就是二代测序序列短,拼接肯定困难。可以用一个参考基因组做mapping试试,不过这种准确度不好,还是要简单的测序验证一下
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13楼
2023-06-26 08:50:13
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wdmzdywe
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13楼
:
Originally posted by
AD_com
at 2023-06-26 08:50:13
当然可以,看你测序深度和基因组大小,理论上现在重测序都十几几十倍,所以理论上是可以组装基因组的,不过还有一个问题就是二代测序序列短,拼接肯定困难。可以用一个参考基因组做mapping试试,不过这种准确度不好 ...
谢谢!
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14楼
2023-06-28 00:31:45
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wyj970
2楼
2023-06-22 05:12
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nono2009
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XG-WUST
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tzynew
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bodygb
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psh19890219
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xn8008
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云在青天
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2023-06-22 07:53
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bluesky9999
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2023-06-22 08:24
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一点也不简单
11楼
2023-06-22 09:04
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白羊line82
12楼
2023-06-22 09:12
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