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wdmzdywe

新虫 (初入文坛)


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重测序可以知道某个基因的序列吗
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重测序的结果为SNP、拷贝数变异、结构变异,既然我都测了全基因组了,那我可不可以在测序结果中得到某一基因的序列呢,这样我就不要扩基因测序了

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当然可以,看你测序深度和基因组大小,理论上现在重测序都十几几十倍,所以理论上是可以组装基因组的,不过还有一个问题就是二代测序序列短,拼接肯定困难。可以用一个参考基因组做mapping试试,不过这种准确度不好,还是要简单的测序验证一下
13楼2023-06-26 08:50:13
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wdmzdywe

新虫 (初入文坛)


引用回帖:
13楼: Originally posted by AD_com at 2023-06-26 08:50:13
当然可以,看你测序深度和基因组大小,理论上现在重测序都十几几十倍,所以理论上是可以组装基因组的,不过还有一个问题就是二代测序序列短,拼接肯定困难。可以用一个参考基因组做mapping试试,不过这种准确度不好 ...

谢谢!

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14楼2023-06-28 00:31:45
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wyj9702楼
2023-06-22 05:12   回复  
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nono20093楼
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XG-WUST4楼
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tzynew5楼
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bodygb6楼
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xn80088楼
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