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新虫 (小有名气)

[交流] 一文了解DNA提取常见问题

DNA提取,是科研实验室常用的实验步骤,提取DNA的质量直接影响后续的检测工作,今天小助手将常见的问题进行了一个总结,供大家参考。





一、A260/280比值较低?或者A260/280比值较高?



用水作为洗脱液比较偏低,或者蛋白质残留,但如果操作过程中使用了苯酚,则更可能是苯酚残留。而比较高可能是大量RNA残留,没有使用RNaseA,或RNaseA活性下降。

A260值提示的含量与电泳检测时提示的含量有可见的误差则为苯酚残留。



二、提取的细菌基因组DNA有降解,为什么?







确认选用的培养菌体是否新鲜,如果菌体需要保存时,请于-80℃保存。



起始菌液量过多,导致菌液裂解不充分,部分DNA降解。



菌体本身富含DNA酶活性,加入Digestion solution后再加20uL0.5M EDTA溶液来抑制内源性核酸酶。



三、提取的基因组DNA生物活性差,为什么?





提取的基因组DNA中盐分浓度过高,请严格按照说明书操作。



提取的基因组DNA中含有乙醇。离心的速度和时间应该严格遵循说明书要求进行。



四、为什么用酚与氯仿抽提DNA时,还要加少量的异戊醇?



在抽提DNA时,为了混合均匀,必须剧烈振荡容器数次,这时在混合液内易产生气泡,气泡会阻止相互间的充分作用。加入异戊醇能降低分子表面张力,所以能减少抽提过程中的泡沫产生。一般采用氯仿与异戊醇为24:1之比。也可采用酚、氯仿与异戊醇之比为25:24:1(不必先配制,可在临用前把一份酚加一份24:1的氯仿与异戊醇即成),同时异戊醇有助于分相,使离心后的上层水相,中层变性蛋白相以及下层有机溶剂相维持稳定。
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