应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 关于大片段基因的引物设计
51/1返回列表
查看: 785  |  回复: 11
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前主题已经存档。
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

雨后郁金香

金虫 (小有名气)

[交流] 关于大片段基因的引物设计

本人现在需要设计一个基因的引物，基因有12000多bp,现需设计一对引物，要求PCR产物的大小为2KB~5KB，将该基因的12000多bp序列导入Primer 后，会弹出个对话框，写着：“more than 30000 possible primers. Optimal primers search will be exceedingly time consuming.Please reduce anti-sense primer search range。”想请问各位有什么更好的设计引物的方法来获得该基因啊？？  谢谢达人。。。
回复此楼

» 猜你喜欢
1楼 2009-09-22 19:57:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

雨后郁金香

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by bioxixi at 2009-9-23 08:52:
没有扩过这么长的，觉得引物可能不是问题，酶能扩这么长吗？会不会有很多错配。。。
不知道楼主做什么用途，可以一段一段扩，再拼接

恩，是想做该基因的同源重组的，本来是想克隆到该基因的5端跟3端的一段同源臂，可是PCR的时候有很多的非特异性条带，现在是想验证下我的材料中到底有没有含有这个基因，所以需要设计引物看看能否P出这个基因的全长。。。
赞一下 回复此楼
8楼2009-09-23 09:25:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 12 个回答

菊花茶

木虫 (著名写手)
★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
amisking(金币+3,VIP+0): 9-22 20:23
30000多，都能扩出你的产物吗？
要看你的产物在哪一段，然后用primer5设计，应该不困难，先选择前后primer在哪个范围最合适，再根据Tm值，GC含量，二聚体，错配等进行编辑取舍
赞一下(11人) 回复此楼
2楼2009-09-22 20:12:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

雨后郁金香

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by 菊花茶 at 2009-9-22 20:12:
30000多，都能扩出你的产物吗？
要看你的产物在哪一段，然后用primer5设计，应该不困难，先选择前后primer在哪个范围最合适，再根据Tm值，GC含量，二聚体，错配等进行编辑取舍

是啊，关键是那所谓的30000多个的分值都很低，而且二聚体啦，错配啦什么的都有，值还很大。。。。唉，有点犯难，不知道该如何设计。。。。
赞一下 回复此楼
3楼2009-09-22 20:53:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gastrodia

金虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
剪掉一部分序列再设计引物即可

[ Last edited by gastrodia on 2009-9-22 at 21:00 ]
赞一下(1人) 回复此楼
4楼2009-09-22 20:58:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 12 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 环境学硕288求调剂 +8 皮皮皮123456 2026-03-22 8/400 2026-03-23 23:47 by 热情沙漠
[考研] 0854 考研调剂 招生了！AI 方向 +4 pk3725069 2026-03-19 16/800 2026-03-23 23:09 by 汪！？！
[考研] 284求调剂 +3 yanzhixue111 2026-03-23 6/300 2026-03-23 22:58 by pswait
[考研] 材料/农业专业，07/08开头均可，过线就行 +3 呵唔哦豁 2026-03-23 4/200 2026-03-23 22:30 by 汪！？！
[考研] 生物学一志愿985，分数349求调剂 +6 zxts12 2026-03-21 9/450 2026-03-23 18:37 by macy2011
[考研] 工科0856求调剂 +5 沐析汀汀 2026-03-21 5/250 2026-03-23 17:56 by 海瑟薇-
[考研] 北科281学硕材料求调剂 +8 tcxiaoxx 2026-03-20 9/450 2026-03-23 12:16 by tcxiaoxx
[考研] 298求调剂 +8 上岸6666@ 2026-03-20 8/400 2026-03-23 11:02 by laoshidan
[考研] 0854电子信息求调剂 +3 α____ 2026-03-22 3/150 2026-03-22 21:28 by zhq0425
[考研] 307求调剂 +11 冷笙123 2026-03-17 11/550 2026-03-22 20:16 by edmund7
[考研] 287求调剂 +8 晨昏线与星海 2026-03-19 9/450 2026-03-22 17:01 by i_cooler
[考研] 308求调剂 +3 墨墨漠 2026-03-21 3/150 2026-03-22 16:54 by i_cooler
[考研] 生物学071000 329分求调剂 +5 我爱生物生物爱� 2026-03-17 5/250 2026-03-22 16:42 by tcx007
[考研] 考研调剂 +4 来好运来来来 2026-03-21 4/200 2026-03-22 12:15 by 星空星月
[考研] 考研调剂 +3 呼呼？~+123456 2026-03-21 3/150 2026-03-21 20:04 by 无际的草原
[考研] 求调剂 +3 Ma_xt 2026-03-17 3/150 2026-03-21 02:05 by JourneyLucky
[考研] 华东师范大学-071000生物学-293分-求调剂 +3 研究生何瑶明 2026-03-18 3/150 2026-03-21 01:30 by JourneyLucky
[考研] 一志愿南昌大学，327分，材料与化工085600 +9 Ncdx123456 2026-03-19 9/450 2026-03-20 23:41 by lovewei0727
[考研] 295复试调剂 +8 简木ChuFront 2026-03-19 8/400 2026-03-20 20:44 by zhukairuo
[考研] 0703化学调剂 +3 妮妮ninicgb 2026-03-17 3/150 2026-03-18 10:29 by macy2011
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭