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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » 晶体解析 » 两个ALERT A怎么解决？
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单增梅

铜虫 (初入文坛)

[交流] 两个ALERT A怎么解决？

出现这个PLAT780_ALERT_1_A Coordinates do not Form a Properly Connected Set
和PLAT234_ALERT_4_A Large Hirshfeld Difference C18    --  C43     ..       0.32 Ang
怎么解决？？
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1楼 2009-09-21 11:52:20
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单增梅

铜虫 (初入文坛)
没人知道啊？？？
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2楼2009-09-21 16:11:04
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xiaoyang09

木虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
高手快快现身吧!我也想知道，帮顶
赞一下(1人) 回复此楼
定云止水，鸢飞鱼跃
3楼2009-09-21 18:32:56
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wwt1806

木虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
我也想知道，这个怎么处理，顶一下
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鲲鹏展翅行千里，他日无风假何物？
4楼2009-09-21 21:21:33
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monoclinic

木虫 (小有名气)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
waiy2001(金币+2,VIP+0):谢谢 9-22 11:03
1. 第一个问题可能是有原子不在同一个等效点系。
例如：金属离子上连接了另一个分子上的氧原子。
原子座标可以反映出来，用Hg也可以查看到。

2. 第二个问题要用 DFIX 指令，如：
如： DFIX  1.535  0.0005  C18  C43
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5楼2009-09-21 21:48:42
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今天9088

金虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by monoclinic at 2009-9-21 21:48:
1. 第一个问题可能是有原子不在同一个等效点系。
例如：金属离子上连接了另一个分子上的氧原子。
。

2. 第二个问题要用 DFIX 指令，如：
如： DFIX  1.535  0.0005  ...

请教楼上的高手，“原子座标可以反映出来，用Hg也可以查看到”麻烦您详细介绍一下，非常感谢！
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从零开始奋斗！
6楼2009-09-22 08:34:17
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单增梅

铜虫 (初入文坛)
★
paopaomeng(金币+1,VIP+0):谢谢交流 9-28 18:52
引用回帖:
Originally posted by monoclinic at 2009-9-21 21:48:
1. 第一个问题可能是有原子不在同一个等效点系。
例如：金属离子上连接了另一个分子上的氧原子。
原子座标可以反映出来，用Hg也可以查看到。

2. 第二个问题要用 DFIX 指令，如：
如： DFIX  1.535  0.0005  ...

第一个问题：若不加氢原子就不会出现这个问题，在有机配体上加了氢后才出现的（理论加氢），所以你的这个解答方法行不通啊。
Coordinates do not Form a Properly Connected Set        这句话的解释是

Atoms given in a CIF should form a 'connected set', i.e. no symmetry
operations are needed to get atoms in a bonding position. A connected set of
atoms is not needed for the least squares refinement (unless hydrogen atoms
are to be added at calculated positions). Geometry listings (bonds, angles,
torsions & H-bonds) become unwieldy for non-connected atom sets.
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7楼2009-09-22 08:47:45
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dpzhang

木虫 (正式写手)

你好

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
paopaomeng(金币+1,VIP+0):谢谢交流 9-28 18:52
第一个问题是对称元素太多了，要求用尽量少的对称元素。第二个用simu酒可以了
赞一下(11人) 回复此楼
生活还要继续
8楼2009-09-28 12:38:37
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