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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 【求助】直接从晶体数据导出结构来计算单点能的可信度有多高？
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tiechong

金虫 (著名写手)

[交流] 【求助】直接从晶体数据导出结构来计算单点能的可信度有多高？

如果一个分子比较大，所以优化起来比较费时，如果已经有晶体结构了，要研究这个分子的一些电子性质来跟实验比对，能不能直接用已有的晶体结构数据作为单点能计算的结构。这样做法普遍吗？哪位虫友能举几篇文献参考一下？
还是说一定要计算中优化的结构才能使用？
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1楼 2009-09-20 12:06:31
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psfan

铁虫 (正式写手)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
erylingjet(金币+2,VIP+0):感谢交流 9-20 12:23
晶体结构应该属于固态，而计算的结果多为气态或溶剂中，我看到多数采用晶体结构作为初始构型，再进行气相优化或加溶剂优化。
但是另一方面，气相计算的结果常常和固态的晶体结构作比较来评价算法的精度。
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2楼2009-09-20 12:14:16
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erylingjet

铁杆木虫 (著名写手)
★
yjcmwgk(金币+1,VIP+0):有时候真的会用晶体结构直接计算的 9-20 13:30
不优化就没有意义吧
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3楼2009-09-20 12:23:40
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ZJboy

木虫 (著名写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
yjcmwgk(金币+1,VIP+0): 9-20 13:30
引用回帖:
Originally posted by psfan at 2009-9-20 12:14:
晶体结构应该属于固态，而计算的结果多为气态或溶剂中，我看到多数采用晶体结构作为初始构型，再进行气相优化或加溶剂优化。
但是另一方面，气相计算的结果常常和固态的晶体结构作比较来评价算法的精度。

但问题是，本来就知道是气相中的结构，与晶体结构不完全一致是很正常的吧。以是否符合实验值来判断算法精度真的没问题吗？
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4楼2009-09-20 12:43:58
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

优秀版主
★
erylingjet(金币+1,VIP+0):感谢交流 9-21 09:35
有时候确实需要晶体结构直接计算
比如计算磁性——磁性对分子结构十分敏感，如果计算气态分子的话，与实验值差距往往相当大



小卒签名档：
　 　
　

　
　 　

[ Last edited by yjcmwgk on 2009-9-20 at 13:33 ]
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5楼2009-09-20 13:31:48
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jyzhao1981

木虫 (正式写手)
★ ★
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erylingjet(金币+1,VIP+0):感谢交流 9-21 09:35
这个要看你要研究模型哪个方面的性质，如果性质刚好和固态相联系，那直接取晶体结构不是最好吗？
但关键是楼主你是怎么去晶体结构的。
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人生需要多少等待？
6楼2009-09-20 22:28:45
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tiechong

金虫 (著名写手)
谁能够提供几篇直接用晶体结构研究电子结构，性质的文献，来做参考？
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7楼2009-09-25 05:10:14
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ZJboy

木虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by psfan at 2009-9-20 12:14:
晶体结构应该属于固态，而计算的结果多为气态或溶剂中，我看到多数采用晶体结构作为初始构型，再进行气相优化或加溶剂优化。
但是另一方面，气相计算的结果常常和固态的晶体结构作比较来评价算法的精度。

但问题是，气相中的结构与固相中的结构不一样不是很正常吗？如果算出来的结果与固相实验数据完全相同，那不是更奇怪吗？
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8楼2010-01-01 17:39:04
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ZJboy

木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by ZJboy at 2010-1-1 17:39:

但问题是，气相中的结构与固相中的结构不一样不是很正常吗？如果算出来的结果与固相实验数据完全相同，那不是更奇怪吗？

不好意思，我忘了之前我曾回复过这个话题。非常抱歉......
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9楼2010-01-01 17:40:39
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gnli

铜虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
应该优化吧
如果楼主没有找到直接计算的文献
计算和实验有一定误差才正常啊
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争取早日成为合格的菜鸟
10楼2010-01-01 22:06:44
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