【求助】如何将windows里的mol文件转到linux里

11楼2009-11-14 16:00:49

bbslover

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Originally posted by tjegg at 2009-9-19 21:47:
SYBYL中的Concord，或者用SPL语言编写自动转化。很简单。

hi，concord转化sdf到mol2时候，只能一个一个转化吧，（用菜单的那种），如何才能批量转化呢，不然分子多了，一个一个转累死人了。呵呵。多谢！

12楼2009-11-14 21:36:02

arthurii

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yjcmwgk(金币+1,VIP+0): 11-28 08:11

PP可以转，但是不知道转出来的识别情况如何。反正我以前试过一次用PP转的mol2发给别人，说sybyl打不开。

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13楼2009-11-16 17:01:21

CADD

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【求助】如何将windows里的mol文件转到linux里

大家好，我用chemdrow画的结构，并保存为mol格式，怎么将那些结构转到ubuntu8.04里面继而转到sybyl里那？我是初学者，还希望各位高手指教

14楼2009-11-26 09:28:46

bbslover

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hi,tjegg您好，如何才能批量转化mol2呢，你的三百万个肯定是批量，我有smiles或者sdf文件，如何批量转啊，指点一下吧，我做了很多无用功。谢谢。

引用回帖:

Originally posted by tjegg at 2009-9-20 08:58:
1。保证sdf文件中的健没有问题。2。concord转化中要选择带电荷。

我转了近三百万小分子，个别报错，还是很不错的。

15楼2009-11-28 08:01:54

tjegg

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javacfish(金币+1,VIP+0):鼓励交流 11-29 21:21

用SYBYL中SPL语言编辑，这样就可以批量转化了。24小时开机不停地转。Manual上有详细说明。

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除了你的亲人，没有人应该对你好，对你好的人，一定要珍惜。

16楼2009-11-28 19:41:39

bbslover

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引用回帖:

Originally posted by tjegg at 2009-11-28 19:41:
用SYBYL中SPL语言编辑，这样就可以批量转化了。24小时开机不停地转。Manual上有详细说明。

好的多谢了，是不是学习这个spl就行了，还是concord这个？谢谢了。

17楼2009-11-29 14:27:54

bbslover

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引用回帖:

Originally posted by jbolid at 2009-09-24 09:14:29:
谢谢各位，我用sybyl里的concord模块解决了问题

您好，我也遇到了 sdf 转化 mol2 的问题，请问使用spl写的批量转化吗？一个一个转化mol2 太费力了，能否给点建议呢，谢谢

18楼2010-05-28 20:46:42

jbolid

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引用回帖:

Originally posted by bbslover at 2010-05-28 20:46:42:

您好，我也遇到了 sdf 转化 mol2 的问题，请问使用spl写的批量转化吗？一个一个转化mol2 太费力了，能否给点建议呢，谢谢

这个我没用过，希望有高手可以解答啊。

19楼2010-06-07 17:20:25

nyouyou

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ghcacj(金币+1):谢谢 2010-06-09 13:45:34
jbolid(金币+1): 2010-06-10 16:13:07

chembiooffice就可以直接把SDF转成mol2格式的文件

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20楼2010-06-09 13:03:38