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陈思容

铜虫 (正式写手)

[交流] 求助!!!真菌RNA的提取方法

我要从总的RNA里面P出相关的基因!问题是不知道选用那种方法比较好,是一株烟曲霉,现在已经把摇瓶培养48h,72h的菌体用液氮保存在-80°冰箱里,TRIZOL法,或者是异硫酸氰胍法,有哪位高手指点一下
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holyala

木虫 (著名写手)

砖家


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amisking(金币+3,VIP+0): 10-7 16:56
amisking(金币-3,VIP+0):其他版主已经奖励过,所以扣除!~ 10-7 16:57
菌体用液氮保存在-80℃冰箱里?这句话有点问题......到底是-80冰箱还是液氮啊~?

提取的话,可以首先用研钵将菌体在液氮中研磨成粉末,然后加TRIzol,后面的步骤都差不多,不赘述了。

建议每次都用新鲜的菌,效果会比较好。
2楼2009-09-18 13:34:28
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陈思容

铜虫 (正式写手)

谢谢!

加入液氮后放入-80°冰箱,TRIZOL法师姐说提取培养细胞中的RNA才用的
3楼2009-09-18 13:40:45
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holyala

木虫 (著名写手)

砖家

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司马诸葛(金币+3,VIP+0):谢谢交流 9-18 15:18
加入液氮后放-80冰箱~?呃...很有意思的保存方法。过段时间拿出来,液氮还有吗?

TRIzol用的很多啊,植物、细菌、昆虫等都可以用。不过有一个问题,对真菌来说,液氮研磨可能还不足以破坏它的细胞壁,所以可能还需要用裂解液破壁,然后再加TRIzol。

裂解液的话...你得自己找配方了。

[ Last edited by holyala on 2009-9-18 at 13:54 ]
4楼2009-09-18 13:51:09
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陈思容

铜虫 (正式写手)

谢谢

加液氮保存的目的是为了防止反复冻融!师姐说那个Ttrizol不好用的!异硫酸氰胍法不行吗?
5楼2009-09-18 14:04:17
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linxi8579

铜虫 (正式写手)


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液氮研磨新鲜菌丝,当然菌丝水要脱净,最好用抽滤机处理菌丝。然后加裂解液,这些可以的话用试剂盒来做吧。要经常换手套的,戴口罩的。
6楼2009-09-18 14:06:54
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陈思容

铜虫 (正式写手)

试剂盒,我也想用啊!周围实验室大都用,我们老板很反感用试剂盒之类的东西!没办法,只有配溶液自己提了!脱水的话没有其他方法吗,实验室抽滤机不好用
7楼2009-09-18 14:10:18
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holyala

木虫 (著名写手)

砖家

★ ★ ★
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amisking(金币+2,VIP+0): 10-7 16:57
异硫氰酸胍当然也可以......其实RNA提取最重要的就是避免RNase污染导致降解,其它的都好办。TRIzol也好,异硫氰酸胍也行,都能提出来的,只是效率上略有差异罢了。

至于脱水~~除了抽滤,我只能想到真空冷冻干燥,不过这个恐怕更麻烦

P.S. 老板反感试剂盒...多半是嫌贵。以前我们的小老板也这样,呵呵。
8楼2009-09-18 14:23:08
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陈思容

铜虫 (正式写手)

谢谢

恩,周末先试着用异硫酸氰胍法做下吧!还有就是关于PCR产物的测序问题,师姐说是要用到M13,有人说T载体,总之我不知道PCR完了以后到底是怎么测序的
9楼2009-09-18 14:51:21
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guoguotianwai

金虫 (小有名气)

RNA提取有专门的试剂盒提取,只不过要防止被降解。
10楼2009-09-19 09:35:35
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