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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » 晶体解析 » (已上传PF6-的cif檔..有人可以幫我嗎?)请教各位高手...PF6-阴离子无序的精修怎做....
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staphlee

金虫 (正式写手)
有人可以幫我看看嘛???
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21楼2009-09-19 16:01:02
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staphlee

金虫 (正式写手)
22楼2009-09-21 15:58:46
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xi2004

至尊木虫 (职业作家)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ...
staphlee(金币+50,VIP+0):謝謝老師及時的教導.... 9-23 08:04
staphlee(金币+50,VIP+0):之前的50金币好像不能表示我的感谢之意...所以在加50币币谢谢老师...以下的问题请老师有空帮一下忙吧...谢谢... 9-23 08:50
L.S. 4
acta
BOND
FMAP 2
PLAN 20
eadp f1a f1b
eadp f2a f2b
eadp f3a f3b
eadp f4a f4b
sadi 0.01 f1a f2a f1b f2b f2a f3a f3a f4a f4a f1a f2b f3b f3b f4b f4b f1b
sadi 0.01 p2 f1a p2 f1b p2 f2a p2 f2b p2 f3a p2 f3b p2 f4a p2 f4b
WGHT    0.100000
rem EXTI    0.000000
FVAR       0.29321 0.7
P2    5   0.45301   0.09894   0.26875  11.00000   0.01864
F6    4   0.52397   0.11744   0.17845  11.00000   0.03489
F5    4   0.38271   0.07916   0.35881  11.00000   0.04181
part 1
F2A   4   0.49839   0.14335   0.35059  21.00000   0.06893
F4A   4   0.40800   0.05358   0.18820  21.00000   0.07271
F1A   4   0.29870   0.10830   0.17200  21.00000   0.05000
F3A   4   0.59967   0.07540   0.35146  21.00000   0.05025
PART 2
F4B   4   0.35070   0.06200   0.17790  -21.00000   0.05000
F3B   4   0.56240   0.05740   0.32440  -21.00000   0.05000
F2B   4   0.56420   0.13890   0.35740  -21.00000   0.05000
F1B   4   0.31061   0.12680   0.19241  -21.00000   0.07362
PART 0
HKLF 4

[ Last edited by xi2004 on 2009-9-23 at 09:52 ]
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xi2004-emuch@163.com
23楼2009-09-22 23:38:15
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staphlee

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by xi2004 at 2009-9-22 23:38:
L.S. 4
acta
BOND
FMAP 2
PLAN 20
eadp f1a f1b
eadp f2a f2b
eadp f3a f3b
eadp f4a f4b
sadi 0.01 f1a f2a f1b f2b f2a f3a f3a f4a f4a f1a f2b f3b f3b f4b f4b f1b
sadi 0.01 p2 f1a p2 f1b p2 f2 ...

xi2004老师...谢谢你的指导...可是我看了你给我的指令...我有以下问题... ><...
(谢谢老师了...我知道问题很多...但是我想这篇文可以顺便给一些像我一样解无序结构的新手有一些体会...拜托你了...)

1.在eadp指令的前后....需要用exyz指令嘛???兩者需要同時使用嘛??
何时才需要用???如果要用是不是如下:
exyz f1a f1b
exyz f2a f2b
exyz f3a f3b
exyz f4a f4b

2. eadp f1a f1b
   eadp f2a f2b
   eadp f3a f3b
   eadp f4a f4b
exyz和eadp的使用时机??...是用在處理无序的原子还是没有无序问题的原子...
因为像陈小明的书上...他是ClO4-....因为他的中心原子Cl没有无序问题...
所以他用了exyz Cl1 Cl1'和eadp Cl1 Cl1'
可是在这边你用这个指令来修正无序的F1~F4....不知道这边您的用意是???

3. sadi 0.01 f1a f2a f1b f2b f2a f3a f3a f4a f4a f1a f2b f3b f3b f4b f4b f1b
     sadi 0.01 p2 f1a p2 f1b p2 f2a p2 f2b p2 f3a p2 f3b p2 f4a p2 f4b
这边你用了sadi指令...请问何时需要用dfix, dang, sadi,或same呢?
为何你选用sadi?

4. rem EXTI 0.000000
你加了rem的意思是??

5. FVAR 0.29321 0.7
你在最后面加上0.7是怎样决定的??我有看过有人用0.5或0.6....
不知道怎样选用这些数字以及其中含意....和如何选用??

6.请问
part 1后面所有的11.00000是不是要改为21.00000....?
part 2后面所有的11.00000是不是要改为-21.00000....?
我还有看过有人改成31.00000的....
这些数字11.00000, 21.00000, 31.00000是什么意思和选用时机?
P2 5 0.45301 0.09894 0.26875 11.00000 0.01864
F6 4 0.52397 0.11744 0.17845 11.00000 0.03489
F5 4 0.38271 0.07916 0.35881 11.00000 0.04181
part 1
F2A 4 0.49839 0.14335 0.35059 11.00000 0.06893
F4A 4 0.40800 0.05358 0.18820 11.00000 0.07271
F1A 4 0.29870 0.10830 0.17200 11.00000 0.05000
F3A 4 0.59967 0.07540 0.35146 11.00000 0.05025
PART 2
F4B 4 0.35070 0.06200 0.17790 11.00000 0.05000
F3B 4 0.56240 0.05740 0.32440 11.00000 0.05000
F2B 4 0.56420 0.13890 0.35740 11.00000 0.05000
F1B 4 0.31061 0.12680 0.19241 11.00000 0.07362
PART 0
HKLF 4

7. ps.另外...四个无序F的位置好像不在一个平面上...这是正常的??

8. 在输入你指导的指令之后....run XL...
如何知道我们这样对无序的结构精修是合理的??
是否经由看R1大大的降低和GooF = S值接近于1呢??
还是要如何看我们这样对于无序结构处理的是否恰当??

再一次的感谢老师....谢谢您.....
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24楼2009-09-23 08:02:35
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xi2004

至尊木虫 (职业作家)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
staphlee(金币+30,VIP+0):謝謝 9-23 12:02
xi2004老师...谢谢你的指导...可是我看了你给我的指令...我有以下问题... ><...
(谢谢老师了...我知道问题很多...但是我想这篇文可以顺便给一些像我一样解无序结构的新手有一些体会...拜托你了...)

1.在eadp指令的前后....需要用exyz指令嘛???兩者需要同時使用嘛??
何时才需要用???如果要用是不是如下:
exyz f1a f1b
exyz f2a f2b
exyz f3a f3b
exyz f4a f4b

exyz是要在"使两个原子的位置重合"时使用的. 一般不用的.只有比如两种金属占据同一位置, 比如某位置同时有Co, Mn时, 才用饿.
2. eadp f1a f1b
   eadp f2a f2b
   eadp f3a f3b
   eadp f4a f4b
exyz和eadp的使用时机??...是用在處理无序的原子还是没有无序问题的原子...
因为像陈小明的书上...他是ClO4-....因为他的中心原子Cl没有无序问题...
所以他用了exyz Cl1 Cl1'和eadp Cl1 Cl1'
可是在这边你用这个指令来修正无序的F1~F4....不知道这边您的用意是???


既然Cl没有无序问题, 用exyz eadp有点画蛇添足. 我一般就不用cl',保留cl就好. 个人看法,仅供参考

3. sadi 0.01 f1a f2a f1b f2b f2a f3a f3a f4a f4a f1a f2b f3b f3b f4b f4b f1b
     sadi 0.01 p2 f1a p2 f1b p2 f2a p2 f2b p2 f3a p2 f3b p2 f4a p2 f4b
这边你用了sadi指令...请问何时需要用dfix, dang, sadi,或same呢?
为何你选用sadi?

same是为了在.ins中自动产生sadi等, 我还不大会用, 所以就不用了.
一般来讲, BF4, PF6, ClO4等, 其中的 B-F, Cl-O, P-F, F...F, O---O距离理想状态下都应是相等的.
所以才用sadi.
如果不用 sadi, 则可能这些距离会修正至很不合理的值, 所以在修正的初始阶段, 是一定要用的. 最后时, 可放开不用试试, 如果不行, 再重新用.

DFIX, DANG和sadi的功能差不多, 但需要知道某两原子之间的合理键长.

4. rem EXTI 0.000000
你加了rem的意思是??

看你的exti值已经是0,了, 所以不必修正了. rem是remember的意思, 表明你用过该instruction,但现在不起作用了.

5. FVAR 0.29321 0.7
你在最后面加上0.7是怎样决定的??我有看过有人用0.5或0.6....
不知道怎样选用这些数字以及其中含意....和如何选用??

这个要看无序的两部分的比例. 要预先有个判断. 0.7表明part 1占70%, part 2占30%


6.请问
part 1后面所有的11.00000是不是要改为21.00000....?
part 2后面所有的11.00000是不是要改为-21.00000....?
我还有看过有人改成31.00000的....

是的, 我忘记改了, 现已编辑.

这些数字11.00000, 21.00000, 31.00000是什么意思和选用时机?

11.00表明没有无序, 是常态.
21.000,表明对应的sof是fvar后的第二个数值. 以此类推.

P2 5 0.45301 0.09894 0.26875 11.00000 0.01864
F6 4 0.52397 0.11744 0.17845 11.00000 0.03489
F5 4 0.38271 0.07916 0.35881 11.00000 0.04181
part 1
F2A 4 0.49839 0.14335 0.35059 11.00000 0.06893
F4A 4 0.40800 0.05358 0.18820 11.00000 0.07271
F1A 4 0.29870 0.10830 0.17200 11.00000 0.05000
F3A 4 0.59967 0.07540 0.35146 11.00000 0.05025
PART 2
F4B 4 0.35070 0.06200 0.17790 11.00000 0.05000
F3B 4 0.56240 0.05740 0.32440 11.00000 0.05000
F2B 4 0.56420 0.13890 0.35740 11.00000 0.05000
F1B 4 0.31061 0.12680 0.19241 11.00000 0.07362
PART 0
HKLF 4

7. ps.另外...四个无序F的位置好像不在一个平面上...这是正常的??

由于数据的缘故, 实际定出的结构和理想状态有偏差是正常的.
如果需要, 可加flat


8. 在输入你指导的指令之后....run XL...
如何知道我们这样对无序的结构精修是合理的??
是否经由看R1大大的降低和GooF = S值接近于1呢??
还是要如何看我们这样对于无序结构处理的是否恰当??


看PF6的几何构型是否合理; F的 Ueq等是否正常,下降, 看q1-q4是否消失, 看R是不是降下来.
S值可调节, 所以一般不看.

再一次的感谢老师....谢谢您.....

太客气, 说了好几次了.
谢谢你的bb
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xi2004-emuch@163.com
25楼2009-09-23 10:09:33
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staphlee

金虫 (正式写手)
哇...谢谢老师这么快速的回应...

3. .....有关你说"DFIX, DANG和sadi的功能差不多,但需要知道某两原子之间的合理键长."...

那这些合理的键长要去哪里查询呢??有公认值吗??

5. "FVAR 0.29321 0.7这个要看无序的两部分的比例.要预先有个判断. 0.7表明part 1占70%, part 2占30%"

所以这个例子你是怎样判断用0.7的呢??是""感觉""吗??从图中怎样看呢??
我下次怎知道我要用0.5, 0.6,还是0.7??要怎样从哪里判断或猜测??


6. "21.000,表明对应的sof是fvar后的第二个数值.以此类推."

所以这边用21.00000是因为上面的FVAR是0.29321...因为他的第二个数字(也就是小数点第一个数字)是2...所以是这边才用21.00000嘛??
所以?1.00000中...问号?的数字就是看FVAR的第二个数字....这是什么意思阿??

8.我用你的方法解完...Ueq分别是
F6=0.03704
F5=0.04736
F2A=0.04591
F4A=0.05472
F1A=0.06088
F3A=0.03395
F4B=0.05472
F3B=0.03395
F2B=0.04591
F1B=0.06088

R1=0.0331
GooF=S=1.126
Highest Peak=0.92
deepest hole= -1.01
这是在加完氢后...精修一遍而已...还没用建议权重精修...我想应该修完会更好吧....
如果依照目前这样看来....Ueq这样看起来ok嘛??有的是0.03多...有的是0.06多...这样可以说他们没有差异很大嘛???

请老师在帮我解答一下....谢谢啰......感觉受益良多呢.....
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26楼2009-09-23 12:01:18
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xi2004

至尊木虫 (职业作家)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
staphlee(金币+30,VIP+0):謝謝老師... 9-23 16:17
[quote]Originally posted by staphlee at 2009-9-23 12:01:
哇...谢谢老师这么快速的回应...

哇...谢谢老师这么快速的回应...

3. .....有关你说"DFIX, DANG和sadi的功能差不多,但需要知道某两原子之间的合理键长."...

那这些合理的键长要去哪里查询呢??有公认值吗??

BF, PF等键长， 还有大多数的键长都有公认范围的。 这就是为何每个结构， 都要讨论主要键长和已知的结构类似， 然后引用文献....

具体是有若干表格的， 应该在一些书上和Acta 上能找到。


5. "FVAR 0.29321 0.7这个要看无序的两部分的比例.要预先有个判断. 0.7表明part 1占70%, part 2占30%"

所以这个例子你是怎样判断用0.7的呢??是""感觉""吗??从图中怎样看呢??
我下次怎知道我要用0.5, 0.6,还是0.7??要怎样从哪里判断或猜测??

一般情况从0.5开始是可以的， 一般不影响。怎样判断， 当然看那些无序对应的残余峰有多高。


6. "21.000,表明对应的sof是fvar后的第二个数值.以此类推."

所以这边用21.00000是因为上面的FVAR是0.29321...因为他的第二个数字(也就是小数点第一个数字)是2...所以是这边才用21.00000嘛??
所以?1.00000中...问号?的数字就是看FVAR的第二个数字....这是什么意思阿??

第二个数值， 不是0.293的第二位。 在你这个例子就是对应的0.7。
0.7是fvar后的第2个数吧？ 建议认真读shelx说明书


8.我用你的方法解完...Ueq分别是
F6=0.03704
F5=0.04736
F2A=0.04591
F4A=0.05472
F1A=0.06088
F3A=0.03395
F4B=0.05472
F3B=0.03395
F2B=0.04591
F1B=0.06088

R1=0.0331
GooF=S=1.126
Highest Peak=0.92
deepest hole= -1.01
这是在加完氢后...精修一遍而已...还没用建议权重精修...我想应该修完会更好吧....
如果依照目前这样看来....Ueq这样看起来ok嘛??有的是0.03多...有的是0.06多...这样可以说他们没有差异很大嘛???

行不行听checkcif的

请老师在帮我解答一下....谢谢啰......感觉受益良多呢.....
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xi2004-emuch@163.com
27楼2009-09-23 16:06:57
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staphlee

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by xi2004 at 2009-9-23 16:06:
[quote]Originally posted by staphlee at 2009-9-23 12:01:
哇...谢谢老师这么快速的回应...

哇...谢谢老师这么快速的回应...

3. .....有关你说"DFIX, DANG和sadi的功能差不多,但需要知道某 ...

感谢老师了....自学有点辛苦....不过有问题在这边问老师的话...受益匪浅....有问题在请教你了....谢谢
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28楼2009-09-23 16:19:37
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