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staphlee

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[交流] (已上传PF6-的cif檔..有人可以幫我嗎?)请教各位高手...PF6-阴离子无序的精修怎做....

请教各位高手...PF6-阴离子无序的精修怎做....
我的PF6-阴离子每个F都有两个位置....
有人可以把详细的精修指令和情形回复一下嘛
感谢

我把我的PF6-部分的cif上传到纳米盘 (裡面有四個Q峰分別在四個F的旁邊, Q1-Q4)
请高手帮我看一下怎样比较好

http://www.namipan.com/d/1.cif/e ... aef30b30fd8b8090000

[ Last edited by staphlee on 2009-9-21 at 15:58 ]

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1楼 2009-09-17 11:19:30

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xi2004

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小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
staphlee(金币+30,VIP+0):謝謝 9-23 12:02

xi2004老师...谢谢你的指导...可是我看了你给我的指令...我有以下问题... ><...
(谢谢老师了...我知道问题很多...但是我想这篇文可以顺便给一些像我一样解无序结构的新手有一些体会...拜托你了...)

1.在eadp指令的前后....需要用exyz指令嘛???兩者需要同時使用嘛??
何时才需要用???如果要用是不是如下:
exyz f1a f1b
exyz f2a f2b
exyz f3a f3b
exyz f4a f4b

exyz是要在"使两个原子的位置重合"时使用的. 一般不用的.只有比如两种金属占据同一位置, 比如某位置同时有Co, Mn时, 才用饿.
2. eadp f1a f1b
eadp f2a f2b
eadp f3a f3b
eadp f4a f4b
exyz和eadp的使用时机??...是用在處理无序的原子还是没有无序问题的原子...
因为像陈小明的书上...他是ClO4-....因为他的中心原子Cl没有无序问题...
所以他用了exyz Cl1 Cl1'和eadp Cl1 Cl1'
可是在这边你用这个指令来修正无序的F1~F4....不知道这边您的用意是???

既然Cl没有无序问题, 用exyz eadp有点画蛇添足. 我一般就不用cl',保留cl就好. 个人看法,仅供参考

3. sadi 0.01 f1a f2a f1b f2b f2a f3a f3a f4a f4a f1a f2b f3b f3b f4b f4b f1b
sadi 0.01 p2 f1a p2 f1b p2 f2a p2 f2b p2 f3a p2 f3b p2 f4a p2 f4b
这边你用了sadi指令...请问何时需要用dfix, dang, sadi,或same呢?
为何你选用sadi?

same是为了在.ins中自动产生sadi等, 我还不大会用, 所以就不用了.
一般来讲, BF4, PF6, ClO4等, 其中的 B-F, Cl-O, P-F, F...F, O---O距离理想状态下都应是相等的.
所以才用sadi.
如果不用 sadi, 则可能这些距离会修正至很不合理的值, 所以在修正的初始阶段, 是一定要用的. 最后时, 可放开不用试试, 如果不行, 再重新用.

DFIX, DANG和sadi的功能差不多, 但需要知道某两原子之间的合理键长.

4. rem EXTI 0.000000
你加了rem的意思是??

看你的exti值已经是0,了, 所以不必修正了. rem是remember的意思, 表明你用过该instruction,但现在不起作用了.

5. FVAR 0.29321 0.7
你在最后面加上0.7是怎样决定的??我有看过有人用0.5或0.6....
不知道怎样选用这些数字以及其中含意....和如何选用??

这个要看无序的两部分的比例. 要预先有个判断. 0.7表明part 1占70%, part 2占30%

6.请问
part 1后面所有的11.00000是不是要改为21.00000....?
part 2后面所有的11.00000是不是要改为-21.00000....?
我还有看过有人改成31.00000的....

是的, 我忘记改了, 现已编辑.

这些数字11.00000, 21.00000, 31.00000是什么意思和选用时机?

11.00表明没有无序, 是常态.
21.000,表明对应的sof是fvar后的第二个数值. 以此类推.

P2 5 0.45301 0.09894 0.26875 11.00000 0.01864
F6 4 0.52397 0.11744 0.17845 11.00000 0.03489
F5 4 0.38271 0.07916 0.35881 11.00000 0.04181
part 1
F2A 4 0.49839 0.14335 0.35059 11.00000 0.06893
F4A 4 0.40800 0.05358 0.18820 11.00000 0.07271
F1A 4 0.29870 0.10830 0.17200 11.00000 0.05000
F3A 4 0.59967 0.07540 0.35146 11.00000 0.05025
PART 2
F4B 4 0.35070 0.06200 0.17790 11.00000 0.05000
F3B 4 0.56240 0.05740 0.32440 11.00000 0.05000
F2B 4 0.56420 0.13890 0.35740 11.00000 0.05000
F1B 4 0.31061 0.12680 0.19241 11.00000 0.07362
PART 0
HKLF 4

7. ps.另外...四个无序F的位置好像不在一个平面上...这是正常的??

由于数据的缘故, 实际定出的结构和理想状态有偏差是正常的.
如果需要, 可加flat

8. 在输入你指导的指令之后....run XL...
如何知道我们这样对无序的结构精修是合理的??
是否经由看R1大大的降低和GooF = S值接近于1呢??
还是要如何看我们这样对于无序结构处理的是否恰当??

看PF6的几何构型是否合理; F的 Ueq等是否正常,下降, 看q1-q4是否消失, 看R是不是降下来.
S值可调节, 所以一般不看.

再一次的感谢老师....谢谢您.....

太客气, 说了好几次了.
谢谢你的bb

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xi2004-emuch@163.com

25楼2009-09-23 10:09:33

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yinpanchao

新虫 (小有名气)

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staphlee(金币+5,VIP+0): 9-17 11:57
eeqeeq0002(金币+2,VIP+0):谢谢参与 9-17 20:03

首先在xp中把所有的F按两组分别标记A和B。例如F1A,F1B,F2A,F2B........
之后再ins中用EXYZ P1 P2, EADP P1 P2
FVAR **** 0.5
....
.....
PART 1
P1
F1A
F1B
F1C
...
F1F
PART 2
F1A
F1B
F1C
...
F1F
PART 0
注意要把part 1中原子的占有率改为 21
part 2中的占有率改为 -21

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2楼2009-09-17 11:40:30

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