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staphlee

金虫 (正式写手)

[交流] (已上传PF6-的cif檔..有人可以幫我嗎?)请教各位高手...PF6-阴离子无序的精修怎做....

请教各位高手...PF6-阴离子无序的精修怎做....
我的PF6-阴离子每个F都有两个位置....
有人可以把详细的精修指令和情形回复一下嘛
感谢

我把我的PF6-部分的cif上传到纳米盘 (裡面有四個Q峰分別在四個F的旁邊, Q1-Q4)
请高手帮我看一下怎样比较好

http://www.namipan.com/d/1.cif/e ... aef30b30fd8b8090000

[ Last edited by staphlee on 2009-9-21 at 15:58 ]
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staphlee

金虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by xi2004 at 2009-9-22 23:38:
L.S. 4
acta
BOND
FMAP 2
PLAN 20
eadp f1a f1b
eadp f2a f2b
eadp f3a f3b
eadp f4a f4b
sadi 0.01 f1a f2a f1b f2b f2a f3a f3a f4a f4a f1a f2b f3b f3b f4b f4b f1b
sadi 0.01 p2 f1a p2 f1b p2 f2 ...

xi2004老师...谢谢你的指导...可是我看了你给我的指令...我有以下问题... ><...
(谢谢老师了...我知道问题很多...但是我想这篇文可以顺便给一些像我一样解无序结构的新手有一些体会...拜托你了...)

1.在eadp指令的前后....需要用exyz指令嘛???兩者需要同時使用嘛??
何时才需要用???如果要用是不是如下:
exyz f1a f1b
exyz f2a f2b
exyz f3a f3b
exyz f4a f4b

2. eadp f1a f1b
   eadp f2a f2b
   eadp f3a f3b
   eadp f4a f4b
exyz和eadp的使用时机??...是用在處理无序的原子还是没有无序问题的原子...
因为像陈小明的书上...他是ClO4-....因为他的中心原子Cl没有无序问题...
所以他用了exyz Cl1 Cl1'和eadp Cl1 Cl1'
可是在这边你用这个指令来修正无序的F1~F4....不知道这边您的用意是???

3. sadi 0.01 f1a f2a f1b f2b f2a f3a f3a f4a f4a f1a f2b f3b f3b f4b f4b f1b
     sadi 0.01 p2 f1a p2 f1b p2 f2a p2 f2b p2 f3a p2 f3b p2 f4a p2 f4b
这边你用了sadi指令...请问何时需要用dfix, dang, sadi,或same呢?
为何你选用sadi?

4. rem EXTI 0.000000
你加了rem的意思是??

5. FVAR 0.29321 0.7
你在最后面加上0.7是怎样决定的??我有看过有人用0.5或0.6....
不知道怎样选用这些数字以及其中含意....和如何选用??

6.请问
part 1后面所有的11.00000是不是要改为21.00000....?
part 2后面所有的11.00000是不是要改为-21.00000....?
我还有看过有人改成31.00000的....
这些数字11.00000, 21.00000, 31.00000是什么意思和选用时机?
P2 5 0.45301 0.09894 0.26875 11.00000 0.01864
F6 4 0.52397 0.11744 0.17845 11.00000 0.03489
F5 4 0.38271 0.07916 0.35881 11.00000 0.04181
part 1
F2A 4 0.49839 0.14335 0.35059 11.00000 0.06893
F4A 4 0.40800 0.05358 0.18820 11.00000 0.07271
F1A 4 0.29870 0.10830 0.17200 11.00000 0.05000
F3A 4 0.59967 0.07540 0.35146 11.00000 0.05025
PART 2
F4B 4 0.35070 0.06200 0.17790 11.00000 0.05000
F3B 4 0.56240 0.05740 0.32440 11.00000 0.05000
F2B 4 0.56420 0.13890 0.35740 11.00000 0.05000
F1B 4 0.31061 0.12680 0.19241 11.00000 0.07362
PART 0
HKLF 4

7. ps.另外...四个无序F的位置好像不在一个平面上...这是正常的??

8. 在输入你指导的指令之后....run XL...
如何知道我们这样对无序的结构精修是合理的??
是否经由看R1大大的降低和GooF = S值接近于1呢??
还是要如何看我们这样对于无序结构处理的是否恰当??

再一次的感谢老师....谢谢您.....
24楼2009-09-23 08:02:35
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yinpanchao

新虫 (小有名气)

answer

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
staphlee(金币+5,VIP+0): 9-17 11:57
eeqeeq0002(金币+2,VIP+0):谢谢参与 9-17 20:03
首先在xp中把所有的F按两组分别标记A和B。例如F1A,F1B,F2A,F2B........
之后再ins中用EXYZ P1 P2, EADP P1 P2
FVAR ****  0.5
....
.....
PART 1
P1
F1A
F1B
F1C
...
F1F
PART 2
F1A
F1B
F1C
...
F1F
PART 0
注意要把part 1中原子的占有率改为 21
part 2中的占有率改为 -21
2楼2009-09-17 11:40:30
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xwtustc

铜虫 (小有名气)

★ ★ ★
staphlee(金币+1,VIP+0): 9-17 11:57
eeqeeq0002(金币+1,VIP+0):谢谢参与 9-17 20:02
eeqeeq0002(金币+1,VIP+0):谢谢参与 9-17 20:03
可以参考陈小明老师的《单晶结构解析》,十一章部分,其中的“高氯酸根”无序精修写的很详细了,PF6-很类似
3楼2009-09-17 11:41:18
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yinpanchao

新虫 (小有名气)

Answer

★ ★
staphlee(金币+1,VIP+0): 9-17 11:58
eeqeeq0002(金币+1,VIP+0):谢谢参与 9-17 20:03
P1, P2的坐标是一样的。
4楼2009-09-17 11:42:35
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