应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 【求助】gaussian 中oniom如何设置
51/1返回列表
查看: 707  |  回复: 4
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前主题已经存档。
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

zhaoyuling

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助】gaussian 中oniom如何设置

用gaussian计算，采用oniom模型，但一直报错，缺少原子参数，我的input文件如下：%chk=2layer3.chk
%mem=128MW
%nprocshared=4
# opt oniom(b3lyp/sto-3g:amber)

3

0 1 0 2 0 2
C-CV--0.094000   0   -2.23654200    1.20363900    0.22320900 H
C-CV--0.062000   0   -0.89294800    1.34761700    0.03032600 H
C-CK--0.024000   0   -1.40426800   -0.77038800   -0.30985300 H
N-N*--0.090000   0   -2.53765700   -0.12870200    0.00638400 H
H-H4-0.259000    0   -2.99412800    1.92610700    0.48749900 H
H-H4-0.259000    0   -0.26202000    2.22093200    0.09730600 H
H-H5-0.265000    0   -1.32352400   -1.82309600   -0.53764300 H
N-N*--0.148000   0   -0.39044700    0.10341800   -0.30423000 H
C-CT--0.580000   0    1.03386500   -0.21796400   -0.56600300 H
H-H1-0.255000    0    1.39877700    0.53279200   -1.27116200 H
H-H1-0.230000    0    1.04898000   -1.18644100   -1.07432400 H
C-CT--0.348000   0   -3.87548200   -0.73301200    0.09737400 H
H-H1-0.269000    0   -4.26554900   -0.60075500    1.10879700 H
H-H1-0.270000    0   -4.53974000   -0.25614400   -0.62655100 H
H-H1-0.242000    0   -3.79893600   -1.79768700   -0.12611900 H
C-CT--0.108000   0    1.86833900   -0.25528900    0.72026100 H
H-HC-0.221000    0    1.82797200    0.72676900    1.21055600 H
H-HC-0.217000    0    1.41507000   -0.97699800    1.41227500 H
C-CT--0.448000   0    3.33650300   -0.64112100    0.45949700 H
H-HC-0.226000    0    3.81909500   -0.76731400    1.43588700 H
H-HC-0.209000    0    3.37386500   -1.62683400   -0.02526400 H
C-CT--0.657000   0    4.13009100    0.37956900   -0.36674800 H
H-HC-0.230000    0    5.18129300    0.08130700   -0.43496800 H
H-HC-0.195000    0    3.75791100    0.47140700   -1.39462200 H
H-HC-0.214000    0    4.10031000    1.37463900    0.09487400 H
Na-0.871         0    2.90854900   -3.57197175   -0.03086612 H
O-1.313          0    0.84887333   -3.57216657    0.00568620 H
H-0.442          0   -0.11097553   -3.57225736    0.02272029 H
B-0.640          0   -2.34029558   -4.16318202   -0.03865255 H
F-0.410          0   -1.85362049   -3.47493776    1.15343268 H
F-0.410          0   -3.80029558   -4.16316403   -0.03865255 H
F-0.410          0   -1.85364562   -5.53968913   -0.03865255 H
F-0.410          0   -1.85362049   -3.47493776   -1.23073778 H
O-OW--0.834000   0    4.66928631    2.47247377    2.95189442 L H-HC 22 0.0000
H-HW-0.417000    0    5.62928631    2.47247377    2.95189442 L
H-HW-0.417000    0    4.34883173    3.37740960    2.95189442 L
O-OW--0.834000   0   -1.84857718    2.93351507    2.43562733 L
H-HW-0.417000    0   -0.88857718    2.93351507    2.43562733 L
H-HW-0.417000    0   -2.16903176    3.83845090    2.43562733 L
O-OW--0.834000   0   -4.77020101    2.88960414    2.06212696 L
H-HW-0.417000    0   -3.81020101    2.88960414    2.06212696 L
H-HW-0.417000    0   -5.09065560    3.79453997    2.06212696 L
O-OW--0.834000   0   -6.62550401    1.37646499    0.99300331 L
H-HW-0.417000    0   -5.66550401    1.37646499    0.99300331 L
H-HW-0.417000    0   -6.94595860    2.28140082    0.99300331 L
O-OW--0.834000   0   -7.02915227   -1.49739091   -0.67162524 L
H-HW-0.417000    0   -6.06915227   -1.49739091   -0.67162524 L
H-HW-0.417000    0   -7.34960686   -0.59245508   -0.67162524 L
O-OW--0.834000   0   -6.37127878   -4.00956101   -2.09696592 L
H-HW-0.417000    0   -5.41127878   -4.00956101   -2.09696592 L
H-HW-0.417000    0   -6.69173337   -3.10462518   -2.09696592 L
O-OW--0.834000   0   -3.86448308   -5.95395527   -2.96402406 L
H-HW-0.417000    0   -2.90448308   -5.95395527   -2.96402406 L
H-HW-0.417000    0   -4.18493767   -5.04901944   -2.96402406 L
O-OW--0.834000   0    0.26073711   -6.16146599   -2.61079208 L
H-HW-0.417000    0    1.22073711   -6.16146599   -2.61079208 L
H-HW-0.417000    0   -0.05971747   -5.25653016   -2.61079208 L
O-OW--0.834000   0    5.37637024   -4.84358262   -1.23594148 L
H-HW-0.417000    0    6.33637024   -4.84358262   -1.23594148 L
H-HW-0.417000    0    5.05591566   -3.93864679   -1.23594148 L
O-OW--0.834000   0    6.43807914   -2.51451379    0.26867686 L
H-HW-0.417000    0    7.39807914   -2.51451379    0.26867686 L
H-HW-0.417000    0    6.11762455   -1.60957796    0.26867686 L
O-OW--0.834000   0    6.61022859    0.58918395    2.01191554 L
H-HW-0.417000    0    7.57022859    0.58918395    2.01191554 L
H-HW-0.417000    0    6.28977400    1.49411978    2.01191554 L
O-OW--0.834000   0   -1.53804287   -5.93444965    2.69241172 L
H-HW-0.417000    0   -0.57804287   -5.93444965    2.69241172 L
H-HW-0.417000    0   -1.85849745   -5.02951382    2.69241172 L
O-OW--0.834000   0   -1.00518557   -3.95019808    4.92633356 L
H-HW-0.417000    0   -0.04518557   -3.95019808    4.92633356 L
H-HW-0.417000    0   -1.32564015   -3.04526225    4.92633356 L
O-OW--0.834000   0   -0.23269794   -0.91994180    5.28809057 L
H-HW-0.417000    0    0.72730206   -0.91994180    5.28809057 L
H-HW-0.417000    0   -0.55315252   -0.01500597    5.28809057 L
O-OW--0.834000   0    0.44288305    1.45231292    4.58124924 L
H-HW-0.417000    0    1.40288305    1.45231292    4.58124924 L
H-HW-0.417000    0    0.12242846    2.35724875    4.58124924 L
O-OW--0.834000   0    1.29406936    4.60891252   -0.51176718 L
H-HW-0.417000    0    2.25406936    4.60891252   -0.51176718 L
H-HW-0.417000    0    0.97361477    5.51384835   -0.51176718 L
O-OW--0.834000   0    0.75004199    2.87777574   -2.01712815 L
H-HW-0.417000    0    1.71004199    2.87777574   -2.01712815 L
H-HW-0.417000    0    0.42958741    3.78271157   -2.01712815 L
O-OW--0.834000   0   -0.13629448   -0.16306408   -4.39579935 L
H-HW-0.417000    0    0.82370552   -0.16306408   -4.39579935 L
H-HW-0.417000    0   -0.45674907    0.74187175   -4.39579935 L
O-OW--0.834000   0   -1.02006211   -3.59989111   -4.88260759 L
H-HW-0.417000    0   -0.06006211   -3.59989111   -4.88260759 L
H-HW-0.417000    0   -1.34051670   -2.69495528   -4.88260759 L
O-OW--0.834000   0    0.01419202   -1.86281466   -2.83293337 L
H-HW-0.417000    0    0.97419202   -1.86281466   -2.83293337 L
H-HW-0.417000    0   -0.30626257   -0.95787883   -2.83293337 L
O-OW--0.834000   0    0.55105420   -4.28412523   -2.24763623 L
H-HW-0.417000    0    1.51105420   -4.28412523   -2.24763623 L
H-HW-0.417000    0    0.23059961   -3.37918939   -2.24763623 L
O-OW--0.834000   0   -2.73207673    0.53443104   -3.04667129 L
H-HW-0.417000    0   -1.77207673    0.53443104   -3.04667129 L
H-HW-0.417000    0   -3.05253131    1.43936687   -3.04667129 L
O-OW--0.834000   0   -3.94561725   -1.20363649    3.71852134 L
H-HW-0.417000    0   -2.98561725   -1.20363649    3.71852134 L
H-HW-0.417000    0   -4.26607184   -0.29870066    3.71852134 L
O-OW--0.834000   0    2.95953505   -6.34863967   -0.28071433 L
H-HW-0.417000    0    3.91953505   -6.34863967   -0.28071433 L
H-HW-0.417000    0    2.63908047   -5.44370384   -0.28071433 L
O-OW--0.834000   0    3.94852913    2.49029035   -2.07639161 L
H-HW-0.417000    0    4.90852913    2.49029035   -2.07639161 L
H-HW-0.417000    0    3.62807455    3.39522619   -2.07639161 L
O-OW--0.834000   0   -4.06817796    2.01441870   -1.74447742 L
H-HW-0.417000    0   -3.10817796    2.01441870   -1.74447742 L
H-HW-0.417000    0   -4.38863255    2.91935453   -1.74447742 L
O-OW--0.834000   0   -6.09090009    2.69566272   -0.79739777 L
H-HW-0.417000    0   -5.13090009    2.69566272   -0.79739777 L
H-HW-0.417000    0   -6.41135468    3.60059855   -0.79739777 L
O-OW--0.834000   0    2.25998194   -4.65976621    3.60228978 L
H-HW-0.417000    0    3.21998194   -4.65976621    3.60228978 L
H-HW-0.417000    0    1.93952736   -3.75483037    3.60228978 L
O-OW--0.834000   0    2.32104831   -2.15509460   -4.75793149 L
H-HW-0.417000    0    3.28104831   -2.15509460   -4.75793149 L
H-HW-0.417000    0    2.00059373   -1.25015877   -4.75793149 L
O-OW--0.834000   0   -0.67188583    4.47129536    1.69849463 L
H-HW-0.417000    0    0.28811417    4.47129536    1.69849463 L
H-HW-0.417000    0   -0.99234042    5.37623119    1.69849463 L
O-OW--0.834000   0   -4.50700869   -6.75673650    1.41905693 L
H-HW-0.417000    0   -3.54700869   -6.75673650    1.41905693 L
H-HW-0.417000    0   -4.82746328   -5.85180067    1.41905693 L
O-OW--0.834000   0   -3.92848943   -3.86788187   -5.00819201 L
H-HW-0.417000    0   -2.96848943   -3.86788187   -5.00819201 L
H-HW-0.417000    0   -4.24894401   -2.96294604   -5.00819201 L
O-OW--0.834000   0    5.08289743   -0.61443369    5.78960265 L
H-HW-0.417000    0    6.04289743   -0.61443369    5.78960265 L
H-HW-0.417000    0    4.76244285    0.29050214    5.78960265 L

1 2 2.0 4 1.0 5 1.0
2 6 1.0 8 1.0
3 4 1.5 7 1.0 8 1.5
4 12 1.0
5
6
7
8 9 1.0
9 10 1.0 11 1.0 16 1.0
10
11
12 13 1.0 14 1.0 15 1.0
13
14
15
16 17 1.0 18 1.0 19 1.0
17
18
19 20 1.0 21 1.0 22 1.0
20
21
22 23 1.0 24 1.0 25 1.0
23
24
25
26 27 1.0
27 28 1.0
28
29 30 1.0 31 1.0 32 1.0 33 1.0
30
31
32
33
34 35 1.0 36 1.0
35
36
37 38 1.0 39 1.0
38
39
40 41 1.0 42 1.0
41
42
43 44 1.0 45 1.0
44
45
46 47 1.0 48 1.0
47
48
49 50 1.0 51 1.0
50
51
52 53 1.0 54 1.0
53
54
55 56 1.0 57 1.0
56
57
58 59 1.0 60 1.0
59
60
61 62 1.0 63 1.0
62
63
64 65 1.0 66 1.0
65
66
67 68 1.0 69 1.0
68
69
70 71 1.0 72 1.0
71
72
73 74 1.0 75 1.0
74
75
76 77 1.0 78 1.0
77
78
79 80 1.0 81 1.0
80
81
82 83 1.0 84 1.0
83
84
85 86 1.0 87 1.0
86
87
88 89 1.0 90 1.0
89
90
91 92 1.0 93 1.0
92
93
94 95 1.0 96 1.0
95
96
97 98 1.0 99 1.0
98
99
100 101 1.0 102 1.0
101
102
103 104 1.0 105 1.0
104
105
106 107 1.0 108 1.0
107
108
109 110 1.0 111 1.0
110
111
112 113 1.0 114 1.0
113
114
115 116 1.0 117 1.0
116
117
118 119 1.0 120 1.0
119
120
121 122 1.0 123 1.0
122
123
124 125 1.0 126 1.0
125
126
127 128 1.0 129 1.0
128
129
由于是新手，所以不是很懂，望各位大侠多多指点！谢谢！
回复此楼

» 猜你喜欢
1楼 2009-09-16 17:26:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ferlich

禁虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
本帖内容被屏蔽
5楼2009-09-17 19:40:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 5 个回答

erylingjet

铁杆木虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
把出错的信息拿出来，呵呵，也许有人会
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2009-09-17 10:02:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhaoyuling

金虫 (小有名气)
1.最开始没有添加悬挂原子的时候是说缺少原子参数，后来添加悬挂原子
就是上面的输入文件，这个文件的报错是MM function not complete。
2.今天我试着把amber 力场换成uff力场，结果在算了半小时之后出现这样的错误： Error in internal coordinate system.
Error termination via Lnk1e in /home/gaussian/g09/l103.exe
望各位高手多多指点！

[ Last edited by zhaoyuling on 2009-9-17 at 15:12 ]
赞一下 回复此楼
4楼2009-09-17 15:08:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 5 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[论文投稿] 有人投过CCC中国控制会议吗？ 19+3 初九凡 2026-04-26 4/200 2026-05-02 21:11 by Equinoxhua
[考博] 考博 +4 Eternitf 2026-04-29 4/200 2026-05-02 16:10 by yejenny
[考博] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 qs8kylt1wr 2026-05-01 3/150 2026-05-02 15:51 by zahslv263y
[教师之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 qs8kylt1wr 2026-05-01 3/150 2026-05-02 15:36 by zahslv263y
[博后之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 qs8kylt1wr 2026-05-01 3/150 2026-05-02 15:06 by zahslv263y
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 d8tbypao1q 2026-05-01 3/150 2026-05-02 14:21 by zahslv263y
[博后之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 d8tbypao1q 2026-05-01 3/150 2026-05-02 14:06 by zahslv263y
[教师之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 d8tbypao1q 2026-05-01 3/150 2026-05-02 14:06 by zahslv263y
[博后之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 k17zww5nna 2026-05-01 3/150 2026-05-02 10:21 by ovidyohpyz
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 k17zww5nna 2026-05-01 4/200 2026-05-02 10:21 by ovidyohpyz
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 k17zww5nna 2026-05-01 4/200 2026-05-02 10:06 by ovidyohpyz
[教师之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 k17zww5nna 2026-05-01 3/150 2026-05-02 09:36 by dz7y1p1i98
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 k17zww5nna 2026-05-01 5/250 2026-05-02 09:21 by dz7y1p1i98
[考博] 药化及相关博士的申请 5+3 中药学渣 2026-04-29 3/150 2026-05-01 18:14 by babero
[论文投稿] 一篇MDPI论文改变了学习工作和生活 +3 helsinglee 2026-04-29 4/200 2026-05-01 11:45 by bobvan
[有机交流] 一个化合物的合成路线：CAS:367929-02-0 名称：8β-乙烯基雌二醇 50+4 zhquanbing 2026-04-28 4/200 2026-04-30 22:45 by zyqchem
[文学芳草园] 太白金星有点烦 +3 yexuqing 2026-04-27 3/150 2026-04-30 21:56 by myrtle
[考博] 中国地质大学（北京）博士招生补录，数理学院材料科学与工程专业和材料与化工专业 +3 liuxh329 2026-04-29 3/150 2026-04-30 15:42 by 顺利毕业zs
[基金申请] 收到国自然专家邀请后几年才会有本子送过来评 +3 barley5 2026-04-30 3/150 2026-04-30 14:58 by aspect3000
[论文投稿] 有没有快的中文核心比较快录用的，纳米材料光催化 5+3 2914439618 2026-04-27 4/200 2026-04-29 08:59 by 北京莱茵润色
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭