24小时热门版块排行榜    

查看: 1899  |  回复: 7
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

QMMM萌

新虫 (初入文坛)

[交流] Dmol3过渡态搜索出现多个虚频,如何消除多余虚频? 已有4人参与

我的操作步骤是,把ts search计算完成后输出的xsd文件双击为激活状态,点击频率分析,分析出两个虚频(一个-400一个-200)和很多正频率,鼠标选中数值最小的正频率(数值为20,不是双击显示动画,是单击选中),然后打开Dmol3 calculation,选择TS Optimization,点击Run按钮。
1.请问大家,我的操作是否有出错或者遗漏之处?
2.在分析频率后,是否应该选中应保留的虚频?而不是最小的正频率呢?

Dmol3过渡态搜索出现多个虚频,如何消除多余虚频?


发自小木虫Android客户端
回复此楼

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

» 猜你喜欢

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

养生丸子头

新虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
6楼: Originally posted by 卡开发发 at 2023-01-05 13:20:43
一般是跟踪那个沿着反应方向的虚频,使得虚频贡献的模式能量朝上爬,其他方向向下。对你的体系可能要双击那个-161.81 cm^-1的,之后会出现对应频率的振动轨迹,你可以检查这个轨迹的振动方向是否是沿着反应的,实际 ...

您好,请问TS opt后,想要的虚频被优化没了,优化后得到的虚频跟反应方向不一样应该怎么办呢?
7楼2023-01-15 21:43:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 8 个回答

EsperanzaM

银虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
刚开始用MS,请问有两个反应物如何搜索过渡态
2楼2022-12-26 17:07:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

QMMM萌

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by EsperanzaM at 2022-12-26 17:07:26
刚开始用MS,请问有两个反应物如何搜索过渡态

把反应物和产物的模型点开,点reaction preview反应预览,点match匹配,反应物和产物模型里的原子一一对应,然后点击预览preview,生成一个路径文件可以看到反应的动画,点击保存,对这个路径文件点dmol3 calculation,任务选过渡态搜索,参数自己设置

发自小木虫Android客户端
3楼2023-01-03 17:13:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

QMMM萌

新虫 (初入文坛)

这种基础操作哔哩哔哩很多视频

发自小木虫Android客户端
4楼2023-01-03 17:13:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 工科0856专硕化学工程269能调剂吗 +5 我想读研11 2026-03-10 5/250 2026-03-11 07:07 by laoshidan
[考研] 化工0817调剂 +8 灿若星晨 2026-03-10 8/400 2026-03-10 22:44 by 星空星月
[考研] 大连大学化学专业研究生调剂 +3 琪久. 2026-03-10 7/350 2026-03-10 22:41 by Equinoxhua
[考研] 材料工程307,求调剂 +6 我要燃烧你的梦 2026-03-08 6/300 2026-03-10 22:08 by peike
[考研] 调剂 +5 呵唔哦豁 2026-03-10 5/250 2026-03-10 22:00 by 28375m
[考研] 332材料求调剂 +6 zjy101327 2026-03-05 8/400 2026-03-10 17:55 by zjy101327
[考研] 328,0703考生求调剂,一志愿为东北师范大学 +3 观素律 2026-03-09 4/200 2026-03-10 15:58 by houyaoxu
[考研] 材料专硕调剂 +7 慕辰123 2026-03-05 10/500 2026-03-10 14:22 by peike
[考研] 一志愿:武汉理工,材料工程,英二数二 总分314 +3 2202020125 2026-03-10 4/200 2026-03-10 13:54 by xiongyaxuan
[考研] 求调剂 一志愿苏州大学,0856化工323分 | 本科应化 | 有专利/竞赛/科研助手经历 | +7 橙子cyx 2026-03-06 9/450 2026-03-10 12:03 by kiokin
[考研] 考研一志愿长安大学材料与化工309分请求调剂 +6 dtdxzxx 2026-03-06 8/400 2026-03-10 08:31 by Linda Hu
[考研] 0703化学调剂 +7 小奶苍 2026-03-07 7/350 2026-03-10 05:17 by anny19840123
[考研] 材料科学(0805)338 求调剂 +7 xiaokang3286 2026-03-07 7/350 2026-03-08 03:42 by lfhuang
[考研] 一志愿211 化学305分求调剂 +3 0703杨悦305分 2026-03-05 3/150 2026-03-07 21:15 by yinhuanshun
[考研] 一志愿武汉理工085601,初试301分,请问能调剂到湖北吗 +3 肖yang 2026-03-06 3/150 2026-03-07 19:08 by ms629
[考研] 268求调剂 +4 刘合华 2026-03-05 4/200 2026-03-06 11:18 by lature00
[考研] 材料与化工354调剂 +4 Lucy-xiao 2026-03-06 7/350 2026-03-06 09:57 by hxuq8429
[考博] 2026申博自荐 六级440电催化方向 +4 樱落成影花成双 2026-03-05 4/200 2026-03-06 07:57 by L135790
[考研] 282求调剂 +7 夕~日 2026-03-05 8/400 2026-03-05 21:31 by zzpnuli111
[考研] 304求调剂 +3 曼殊2266 2026-03-04 3/150 2026-03-05 10:39 by Iveryant
信息提示
请填处理意见