应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 求助！无参转录组中挑出来的一段序列应该怎么进行后续的实验
51/1返回列表
查看: 835  |  回复: 5
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
【悬赏金币】回答本帖问题，作者灵犀从蕾将赠送您 10 个金币
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

灵犀从蕾

新虫 (正式写手)

[求助] 求助！无参转录组中挑出来的一段序列应该怎么进行后续的实验

各位科研大佬们，求助一下！！
我现在研究的昆虫在NCBI上还没有完整的基因组，搜索我所研究的昆虫也几乎没有什么基因，但是同一个目 的昆虫有比较深入的研究了。这是前提。
正在着手测基因组，但前期测了一个无参的转录组，从中挑选并得到一段序列，公司标注这是cds区的序列
1、我可以利用这段序列用DNAMAN翻译成氨基酸序列并进行后续的预测吗？这准确吗？
2、我用DNAMAN翻译的序列和用NCBI上查到的ORF区序列不太一样，我后续预测理化性质什么的话，我用哪一段比较好呢？
回复此楼

» 猜你喜欢
1楼 2022-06-30 15:54:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

灵犀从蕾

新虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 过烟云烟 at 2022-07-02 09:17:52
能用这段CDS序列扩增该基因的全长吗，有了全长在设计RNA干扰序列的话效果会好很多

因为是无参的，而且查了一下转录组出来的这段序列好像不能确定这是cds序列了...
赞一下 回复此楼
5楼2022-07-02 09:38:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答

YU_DG

木虫 (正式写手)
自己做一个全基因组测序，发一篇好文章呀

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
2楼2022-06-30 16:14:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

灵犀从蕾

新虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by liudayeye at 2022-06-30 16:14:37
自己做一个全基因组测序，发一篇好文章呀

谢谢你，我已经在准备做全基因组了，但前期只做了转录组所以只能根据转录组挑选基因来进行RNA干扰，不知道我以上问题有无好的解答呢？
赞一下 回复此楼
3楼2022-06-30 16:26:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

过烟云烟

铁杆木虫 (著名写手)
能用这段CDS序列扩增该基因的全长吗，有了全长在设计RNA干扰序列的话效果会好很多
赞一下 回复此楼
once you've accepted your flaws, no one can use them against you.
4楼2022-07-02 09:17:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答
不应助 确定回帖应助 (注意：应助才可能被奖励，但不允许灌水，必须填写15个字符以上)
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 环境学硕288求调剂 +6 皮皮皮123456 2026-03-22 6/300 2026-03-22 16:52 by i_cooler
[考研] 寻找调剂 +4 倔强芒? 2026-03-21 4/200 2026-03-22 16:14 by 木托莫露露
[考研] 298求调剂一志愿211 +3 上岸6666@ 2026-03-20 3/150 2026-03-22 15:50 by ColorlessPI
[考研] 260求调剂 +3 朱芷琳 2026-03-20 4/200 2026-03-22 15:12 by 朱芷琳
[考研] 求调剂 +5 Zhangbod 2026-03-21 7/350 2026-03-22 13:13 by Zhangbod
[考研] 求调剂 +7 Auroracx 2026-03-22 7/350 2026-03-22 12:38 by 素颜倾城1988
[基金申请] 山东省面上项目限额评审 +4 石瑞0426 2026-03-19 4/200 2026-03-22 08:50 by Wei_ren
[考研] 资源与环境 调剂申请(333分) +5 holy J 2026-03-21 5/250 2026-03-21 22:42 by Catalysis25
[考研] 广西大学材料导师推荐 +3 夏夏夏小正 2026-03-17 5/250 2026-03-21 22:20 by 金昊ML
[考研] 材料 271求调剂 +5 展信悦_ 2026-03-21 5/250 2026-03-21 17:29 by 学员8dgXkO
[考研] 332求调剂 +4 ydfyh 2026-03-17 4/200 2026-03-21 02:20 by JourneyLucky
[考研] 求调剂 +3 Ma_xt 2026-03-17 3/150 2026-03-21 02:05 by JourneyLucky
[考研] 一志愿西南交大，求调剂 +5 材化逐梦人 2026-03-18 5/250 2026-03-21 00:26 by JourneyLucky
[考研] 274求调剂 +10 S.H1 2026-03-18 10/500 2026-03-20 23:51 by JourneyLucky
[考研] 290求调剂 +7 ^O^乜 2026-03-19 7/350 2026-03-20 21:43 by JourneyLucky
[考研] 一志愿 南京航空航天大学大学 ，080500材料科学与工程学硕 +5 @taotao 2026-03-20 5/250 2026-03-20 20:16 by JourneyLucky
[考研] 求调剂 +3 @taotao 2026-03-20 3/150 2026-03-20 19:35 by JourneyLucky
[考博] 申博26年 +3 八6八68 2026-03-19 3/150 2026-03-19 19:43 by nxgogo
[考研] 085600材料与化工求调剂 +6 绪幸与子 2026-03-17 6/300 2026-03-19 13:27 by houyaoxu
[考博] 26博士申请 +3 1042136743 2026-03-17 3/150 2026-03-17 23:30 by 轻松不少随
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭