24小时热门版块排行榜    

查看: 809  |  回复: 5
【悬赏金币】回答本帖问题,作者灵犀从蕾将赠送您 10 个金币
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

灵犀从蕾

新虫 (正式写手)

[求助] 求助!无参转录组中挑出来的一段序列应该怎么进行后续的实验

各位科研大佬们,求助一下!!
我现在研究的昆虫在NCBI上还没有完整的基因组,搜索我所研究的昆虫也几乎没有什么基因,但是同一个目 的昆虫有比较深入的研究了。这是前提。
正在着手测基因组,但前期测了一个无参的转录组,从中挑选并得到一段序列,公司标注这是cds区的序列
1、我可以利用这段序列用DNAMAN翻译成氨基酸序列并进行后续的预测吗?这准确吗?
2、我用DNAMAN翻译的序列和用NCBI上查到的ORF区序列不太一样,我后续预测理化性质什么的话,我用哪一段比较好呢?
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

过烟云烟

铁杆木虫 (著名写手)

能用这段CDS序列扩增该基因的全长吗,有了全长在设计RNA干扰序列的话效果会好很多
once you've accepted your flaws, no one can use them against you.
4楼2022-07-02 09:17:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答

YU_DG

木虫 (正式写手)

自己做一个全基因组测序,发一篇好文章呀

发自小木虫Android客户端
2楼2022-06-30 16:14:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

灵犀从蕾

新虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by liudayeye at 2022-06-30 16:14:37
自己做一个全基因组测序,发一篇好文章呀

谢谢你,我已经在准备做全基因组了,但前期只做了转录组所以只能根据转录组挑选基因来进行RNA干扰,不知道我以上问题有无好的解答呢?
3楼2022-06-30 16:26:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

灵犀从蕾

新虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 过烟云烟 at 2022-07-02 09:17:52
能用这段CDS序列扩增该基因的全长吗,有了全长在设计RNA干扰序列的话效果会好很多

因为是无参的,而且查了一下转录组出来的这段序列好像不能确定这是cds序列了...
5楼2022-07-02 09:38:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
不应助 确定回帖应助 (注意:应助才可能被奖励,但不允许灌水,必须填写15个字符以上)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 接收调剂 +11 津萌津萌 2026-03-02 19/950 2026-03-03 13:05 by 13779929448
[考研] 化工335求调剂 +5 摸摸猫猫头 2026-03-02 5/250 2026-03-03 09:10 by houyaoxu
[考研] 化工京区271求调剂 +7 11ing 2026-03-02 7/350 2026-03-03 07:30 by 利好利好.
[考研] 298求调剂 +7 axyz3 2026-02-28 8/400 2026-03-03 06:11 by tgxtgxtgx9
[考研] 0854复试调剂 276 +5 wmm9 2026-03-01 7/350 2026-03-03 02:49 by xiadaiyang
[考研] 11408,学硕276求调剂 +3 崔wj 2026-03-02 5/250 2026-03-02 22:14 by 255671
[考研] 0856材料求调剂 +12 hyf hyf hyf 2026-02-28 13/650 2026-03-02 20:19 by hypershenger
[考研] 284求调剂 +5 天下熯 2026-03-02 5/250 2026-03-02 18:38 by caszguilin
[考研] 0703 总分319求调剂 +3 Xinyuu 2026-03-02 3/150 2026-03-02 17:20 by houyaoxu
[考研] 哈工大计算机刘劼团队招生 +4 hit_aiot 2026-03-01 6/300 2026-03-02 11:53 by 一声问好
[考研] 295求调剂 +8 19171856320 2026-02-28 8/400 2026-03-02 11:19 by yuchj
[考研] 264求调剂 +4 巴拉巴拉根556 2026-02-28 4/200 2026-03-02 10:48 by yuchj
[考研] 274求调剂 +3 cgyzqwn 2026-03-01 7/350 2026-03-02 10:38 by lature00
[考研] 材料类求调剂 +11 wana_kiko 2026-02-28 14/700 2026-03-02 08:46 by 聪明的大松鼠
[考研] 328求调剂 +3 aaadim 2026-03-01 5/250 2026-03-01 17:29 by njzyff
[考研] 调剂 +3 简木ChuFront 2026-02-28 3/150 2026-03-01 11:46 by 王伟要上岸啊
[考研] 317一志愿华南理工电气工程求调剂 +6 Soliloquy_Q 2026-02-28 11/550 2026-03-01 11:14 by 歌liekkas
[考研] 311求调剂 +9 南迦720 2026-02-28 10/500 2026-03-01 10:55 by sunny81
[论文投稿] Optics letters投稿被拒求助 30+3 luckyry 2026-02-26 4/200 2026-03-01 09:06 by babero
[高分子] 求环氧树脂研发1名 +3 孙xc 2026-02-25 11/550 2026-02-28 16:57 by ichall
信息提示
请填处理意见