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jinshanli

至尊木虫 (知名作家)

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[求助] 单晶存在B错误同时也没判断出来绝对构型，寻求帮助已有1人参与

新测了一个单晶，想要判断化合物的绝对构型，check结果显示有B错误，同时Flack parameter数值较大无法判断手性，麻烦各位给解决一下，非常感谢！
化合物结构及单晶数据请查阅百度网盘。链接: https://pan.baidu.com/s/1LCfmu6eNY2ir0mLJ3iUiJg?pwd=yngp 提取码: yngp 复制这段内容后打开百度网盘手机App，操作更方便哦@jackdeng@lich666

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@羊倌 @lnxj99

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金山

1楼 2022-06-05 12:49:46

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卡布奇诺7

至尊木虫 (职业作家)

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【答案】应助回帖

引用回帖:

10楼: Originally posted by jinshanli at 2022-06-05 19:45:33
好的，谢谢您...

倒反栾晶，又叫外消旋栾晶，不是内消旋，不好意思打错了；你的晶体是经过表征了，证明是手性纯的嘛？Flack参数x接近于 0.5，现在更流行用Hooft（结构中的Flack是0.65左右，而Hooft是0.57, 更接近0.5，更准确），一个典型的例子发生在具有P21空间群的单斜晶体，在孪晶区具有镜面的对称性。因此，两种光学异构的结构都出现，你的结构刚好是这种情况；精修时一个细节就是：取消你用的AFIX 66后发现苯环上六个碳的振动参数差异很大，并且无序的方向没有规律性，也就直接导致了碳碳精度的问题，这说明了结构不是常规的结构无序振动，而是构型无序，即倒反栾晶，现在的数据质量已经足够判断绝对构型的问题了，更好的情况是等你根据9楼的意见重收好数据后，再做研判