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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » 晶体解析 » 单晶存在B错误同时也没判断出来绝对构型，寻求帮助
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jinshanli

至尊木虫 (知名作家)

[求助] 单晶存在B错误同时也没判断出来绝对构型，寻求帮助 已有1人参与

新测了一个单晶，想要判断化合物的绝对构型，check结果显示有B错误，同时Flack parameter数值较大无法判断手性，麻烦各位给解决一下，非常感谢！
化合物结构及单晶数据请查阅百度网盘。链接: https://pan.baidu.com/s/1LCfmu6eNY2ir0mLJ3iUiJg?pwd=yngp 提取码: yngp 复制这段内容后打开百度网盘手机App，操作更方便哦@jackdeng@lich666
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@羊倌 @lnxj99

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金山
1楼 2022-06-05 12:49:46
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SAFEEEE

木虫 (正式写手)
看起来确实像是晶体质量不好，那个B无所谓，需要有原始衍射图判断下。
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jinshanli
2楼2022-06-05 15:22:08
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匿名

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jinshanli
14楼2022-06-06 09:36:31
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普通回帖

jinshanli

至尊木虫 (知名作家)
送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by SAFEEEE at 2022-06-05 15:22:08
看起来确实像是晶体质量不好，那个B无所谓，需要有原始衍射图判断下。

您好，想请教您一下结构有没有问题，不知道怎么给出的Check文件显示C9和C42两个手性中心，实际上这个化合物就一个手性中心啊
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金山
3楼2022-06-05 15:26:43
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SAFEEEE

木虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by jinshanli at 2022-06-05 15:26:43
您好，想请教您一下结构有没有问题，不知道怎么给出的Check文件显示C9和C42两个手性中心，实际上这个化合物就一个手性中心啊...

你有两个分子在不对称单元啊。你的结构如果晶体质量很好，可以用Mo来确定构型，但是目前看数据高角度衍射很差，应该用Cu测。
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jinshanli
4楼2022-06-05 15:31:35
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SAFEEEE

木虫 (正式写手)
目前的数据，确定构型几率渺茫。如果你有原始衍射图，可以看下衍射到底怎么样，大概率应该是高角度没点。
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5楼2022-06-05 15:34:40
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jinshanli

至尊木虫 (知名作家)
送红花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by SAFEEEE at 2022-06-05 15:31:35
你有两个分子在不对称单元啊。你的结构如果晶体质量很好，可以用Mo来确定构型，但是目前看数据高角度衍射很差，应该用Cu测。...

两个分子？但是这个结构只有一个叔碳手性中心，没有其他的手性因素了，谢谢您的建议，我让测单晶的老师用Cu靶再给测一测看
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金山
6楼2022-06-05 15:45:38
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卡布奇诺7

至尊木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
结构的Hooft值是0.57，基本上可以断定属于倒反栾晶，就是内消旋啊
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jinshanli
取次花丛懒回顾，半缘修道半缘君。
7楼2022-06-05 17:21:34
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jinshanli

至尊木虫 (知名作家)
送红花一朵
引用回帖:
7楼: Originally posted by 卡布奇诺7 at 2022-06-05 17:21:34
结构的Hooft值是0.57，基本上可以断定属于倒反栾晶，就是内消旋啊

您好，您说的我不太明白，我看到之前论坛中有人说旋光纯化合物不可能产生倒反孪晶，这个化合物只有一个手性中心，怎么会是内消旋啊
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金山
8楼2022-06-05 17:46:06
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SAFEEEE

木虫 (正式写手)
引用回帖:
8楼: Originally posted by jinshanli at 2022-06-05 17:46:06
您好，您说的我不太明白，我看到之前论坛中有人说旋光纯化合物不可能产生倒反孪晶，这个化合物只有一个手性中心，怎么会是内消旋啊...

重测吧，不好的数据得出的结论也不可靠，每个晶体的flack 甚至都不一样。

发自小木虫IOS客户端
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9楼2022-06-05 18:17:42
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jinshanli

至尊木虫 (知名作家)
引用回帖:
9楼: Originally posted by SAFEEEE at 2022-06-05 18:17:42
重测吧，不好的数据得出的结论也不可靠，每个晶体的flack 甚至都不一样。
...

好的，谢谢您
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金山
10楼2022-06-05 19:45:33
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