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jinshanli至尊木虫 (知名作家)
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[求助]
单晶存在B错误同时也没判断出来绝对构型，寻求帮助 已有1人参与
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新测了一个单晶，想要判断化合物的绝对构型，check结果显示有B错误，同时Flack parameter数值较大无法判断手性，麻烦各位给解决一下，非常感谢！ 化合物结构及单晶数据请查阅百度网盘。链接: https://pan.baidu.com/s/1LCfmu6eNY2ir0mLJ3iUiJg?pwd=yngp 提取码: yngp 复制这段内容后打开百度网盘手机App，操作更方便哦@jackdeng@lich666 |
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倒反栾晶，也叫外消旋栾晶，不是内消旋，不好意思写错了；你的单晶是经过了表征，确定是手性纯的嘛？Flack参数x接近于 0.5，现在更流行用Hooft值了(这就是为什么你的Flack是0.65左右，而Hooft值是0.57)，一个典型的例子发生在具有P21空间群的单斜晶体，在孪晶区具有镜面的对称性。因此，两种光学异构的结构都出现，你的结构刚好属于这种情况；你的数据质量虽然不是很好，但结构中有S原子，对于Mo靶基本可以确定绝对构型的问题了，在精修时我发现你把所有的苯环全部AFIX 66固定了，取消后你可以发现苯环上的碳原子的无序振动没有规律，是各个方向的随机振动，一个苯环上的六个碳，彼此振动参数(椭球)差异很大，也就导致了碳碳精度的问题，这些情况(非常规无序)足以说明了不是结构无序振动的问题，而是构型无序的问题，即倒反栾晶。目前的数据质量已经足够判断问题了，更好的情况是等你根据9楼的意见重测收好数据后，再做研判 |
11楼2022-06-05 19:54:09
jinshanli2楼2022-06-05 15:22:08
jinshanli
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3楼2022-06-05 15:26:43
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