24小时热门版块排行榜    

查看: 1553  |  回复: 2
【悬赏金币】回答本帖问题,作者mishkar将赠送您 10 个金币

mishkar

新虫 (小有名气)

[求助] 求助,为什么转录组数据显示log2fc<1,而qrtpcr的结果显示相差很大

楼主之前做了转录组测序,以log2fc>1为限制条件筛选差异基因,结果显示有70多个基因下调,100多个基因上调。其中有几个基因的log2fc值大概为0.3-0.6之间,但是我用qrtpcr检测的结果显示基因的表达相差2-5倍,2∧(-ΔΔct)=0.2~0.5左右,虽然这几个基因在转录组测序和qrtpcr中的趋势一样,但差异倍数相差得有点大。我重复做qrtpcr的结果也是一样。

请问各位大神,我这种情况应该怎么办?是哪里出了问题了?数据可以用吗?

@wizardfan @youlinglyw @biostar2009 发自小木虫Android客户端
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yandz680717

木虫 (正式写手)

转录组数据一般还要用qPCR验证,数据不吻合很正常

发自小木虫Android客户端
2楼2022-05-01 09:10:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

mishkar

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by yandz680717 at 2022-05-01 09:10:34
转录组数据一般还要用qPCR验证,数据不吻合很正常

那请问我这种情况应该信哪种结果?转录组测序告诉我这个基因表达上调但是差异倍数不大,但是qrtpcr告诉我差异显著

发自小木虫Android客户端
3楼2022-05-01 12:01:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 mishkar 的主题更新
不应助 确定回帖应助 (注意:应助才可能被奖励,但不允许灌水,必须填写15个字符以上)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 070300化学求调剂 +5 苑豆豆 2026-03-20 5/250 2026-03-23 09:39 by guoliang1816
[考研] 085600材料与化工 +10 安全上岸! 2026-03-16 10/500 2026-03-23 09:31 by Jy?
[考研] 324求调剂 +6 lucky呀呀呀鸭 2026-03-20 6/300 2026-03-22 16:01 by ColorlessPI
[考研] 289求调剂 +7 怀瑾握瑜l 2026-03-20 7/350 2026-03-22 15:57 by ColorlessPI
[考研] 285求调剂 +6 ytter 2026-03-22 6/300 2026-03-22 12:09 by 星空星月
[考研] 广西大学材料导师推荐 +3 夏夏夏小正 2026-03-17 5/250 2026-03-21 22:20 by 金昊ML
[考研] 297求调剂 +3 喜欢还是不甘心 2026-03-20 3/150 2026-03-21 18:33 by 学员8dgXkO
[考研] 材料学硕333求调剂 +3 北道巷 2026-03-18 3/150 2026-03-21 18:17 by 学员8dgXkO
[考研] 311求调剂 +3 勇敢的小吴 2026-03-20 3/150 2026-03-21 17:40 by ColorlessPI
[考研] 313求调剂 +4 肆叁贰壹22 2026-03-19 4/200 2026-03-21 17:33 by ColorlessPI
[考研] 085601调剂 358分 +3 zzzzggh 2026-03-20 4/200 2026-03-21 10:21 by luoyongfeng
[考研] 二本跨考郑大材料306英一数二 +3 z1z2z3879 2026-03-17 3/150 2026-03-21 02:29 by JourneyLucky
[考研] 296求调剂 +6 www_q 2026-03-18 10/500 2026-03-20 23:56 by JourneyLucky
[考研] 一志愿武汉理工材料工程专硕调剂 +9 Doleres 2026-03-19 9/450 2026-03-20 22:36 by JourneyLucky
[考研] 材料学求调剂 +4 Stella_Yao 2026-03-20 4/200 2026-03-20 20:28 by ms629
[考研] 261求B区调剂,科研经历丰富 +3 牛奶很忙 2026-03-20 4/200 2026-03-20 19:34 by JourneyLucky
[论文投稿] 申请回稿延期一个月,编辑同意了。但系统上的时间没变,给编辑又写邮件了,没回复 10+3 wangf9518 2026-03-17 4/200 2026-03-19 23:55 by babero
[考研] 320求调剂0856 +3 不想起名字112 2026-03-19 3/150 2026-03-19 22:53 by 学员8dgXkO
[硕博家园] 湖北工业大学 生命科学与健康学院-课题组招收2026级食品/生物方向硕士 +3 1喜春8 2026-03-17 5/250 2026-03-17 17:18 by ber川cool子
[论文投稿] 有没有大佬发小论文能带我个二作 +3 增锐漏人 2026-03-17 4/200 2026-03-17 09:26 by xs74101122
信息提示
请填处理意见