| 查看: 3000 | 回复: 9 | |||
| 【悬赏金币】回答本帖问题，作者名字太长了将赠送您 5 个金币 | |||
[求助]
力场文件修改 已有3人参与
|
|||
|
sorption中文献让金属用dreiding，其他uff， 是在uff基础上，修改金属原子力场嘛 还有的金属用的uff其他dreiding这样子的要看哪一个，金属到底用的uff还是dreiding 力场文件修改有修改步骤嘛或者一些案例教学之类的  @smutao 发自小木虫Android客户端 |
回复此楼» 猜你喜欢
NSFC申报书里申请人简历中代表性论著还需要在申报书最后的附件里面再上传一遍吗
已经有14人回复
-
材料与化工一志愿南昌大学327求调剂推荐
已经有6人回复
-
化学调剂0703
已经有7人回复
-
327求调剂
已经有11人回复
-
调剂
已经有8人回复
-
梁成伟老师课题组欢迎你的加入
已经有7人回复
-
伙伴们，祝我生日快乐吧
已经有24人回复
-
中科院材料273求调剂
已经有3人回复
-
材料工程专硕274一志愿211求调剂
已经有5人回复
-
本人考085602 化学工程 专硕
已经有8人回复
2楼2022-03-13 13:36:37
【答案】应助回帖
| mof-74中的金属原子用uff力场，而配体骨架结构用dreding力场，而吸附的气体分子通常用trappe力场，sorption做混合力场需要编辑一下。首先需要将MOF.xsd以car结构导出，得到MOF.car和MOF.mdf均用写字板打开，在MOF.car文件中将倒数第三列改为自己想要的符号，如C_R。注意字符不能太多(<4个），否则力场文件中将无法识别，同时设置MOF.mdf文件。保存后重新导入MS，通过右键/Label/Forcefield Type查看设置的力场类型是否正确；然后，用写字板打开一个力场文件，将上述设置的力场类型写入到ATOMTYPES中，最后，在DIAGONAL_VDW部分按照已有参数的格式加入新力场类型的两种力场参数σ和ε，单位分别为Å和kcal/mol，力场文件编辑完毕 |
3楼2022-11-08 20:24:10
4楼2022-11-09 12:14:47
|
力场决定了所有原子间的作用力，如果使用通用力场比如compass，可以得到一个粗糙的结果，但发文章不好发 发自小木虫Android客户端 |
» 本帖已获得的红花（最新10朵）
名字太长了5楼2022-11-09 14:30:17
6楼2022-11-10 12:41:10
7楼2022-11-13 20:13:35
8楼2022-11-14 09:30:50
9楼2022-11-14 12:43:11
【答案】应助回帖
|
老师，您好！我有个问题想请教一下大神，MS sorption模块中UFF力场中没有三配位的铜的参数，我通过添加了Cu2+1的参数，Forcite模块可以认出力场了，但是Sorption还是不行，是我参数哪里还有问题吗？我添加了原子类型那块儿，还有_VDW，还有GENERATOR这儿。其他地方没有本身没有Cu3+1的地方没有添加。非常感谢[爱心] 发自小木虫Android客户端 |
10楼2022-11-20 11:37:48
