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力场文件修改 已有3人参与
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sorption中文献让金属用dreiding，其他uff， 是在uff基础上，修改金属原子力场嘛 还有的金属用的uff其他dreiding这样子的要看哪一个，金属到底用的uff还是dreiding 力场文件修改有修改步骤嘛或者一些案例教学之类的  @smutao 发自小木虫Android客户端 |
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2楼2022-03-13 13:36:37
【答案】应助回帖
| mof-74中的金属原子用uff力场，而配体骨架结构用dreding力场，而吸附的气体分子通常用trappe力场，sorption做混合力场需要编辑一下。首先需要将MOF.xsd以car结构导出，得到MOF.car和MOF.mdf均用写字板打开，在MOF.car文件中将倒数第三列改为自己想要的符号，如C_R。注意字符不能太多(<4个），否则力场文件中将无法识别，同时设置MOF.mdf文件。保存后重新导入MS，通过右键/Label/Forcefield Type查看设置的力场类型是否正确；然后，用写字板打开一个力场文件，将上述设置的力场类型写入到ATOMTYPES中，最后，在DIAGONAL_VDW部分按照已有参数的格式加入新力场类型的两种力场参数σ和ε，单位分别为Å和kcal/mol，力场文件编辑完毕 |
3楼2022-11-08 20:24:10
4楼2022-11-09 12:14:47
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力场决定了所有原子间的作用力，如果使用通用力场比如compass，可以得到一个粗糙的结果，但发文章不好发 发自小木虫Android客户端 |
» 本帖已获得的红花（最新10朵）
名字太长了5楼2022-11-09 14:30:17
6楼2022-11-10 12:41:10
7楼2022-11-13 20:13:35
8楼2022-11-14 09:30:50
9楼2022-11-14 12:43:11
【答案】应助回帖
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老师，您好！我有个问题想请教一下大神，MS sorption模块中UFF力场中没有三配位的铜的参数，我通过添加了Cu2+1的参数，Forcite模块可以认出力场了，但是Sorption还是不行，是我参数哪里还有问题吗？我添加了原子类型那块儿，还有_VDW，还有GENERATOR这儿。其他地方没有本身没有Cu3+1的地方没有添加。非常感谢[爱心] 发自小木虫Android客户端 |
10楼2022-11-20 11:37:48
