应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » PCR相关 » 救救孩子，PCR做了半年了没结果
51/1返回列表
查看: 3316  |  回复: 12
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

拟南芥i

铁虫 (初入文坛)

[交流] 救救孩子，PCR做了半年了没结果 已有7人参与

我首先提取螨虫体的基因组DNA，特异性扩增螨虫基因组中一段稳定遗传且保守的序列ITS2，扩增之后送PCR产物测序，然后比对测序结果得到相似度（大于90%），以这种方法来检定虫种的纯度。
      我有400个虫体样本需要检定，每次检定到100多个虫种时，扩增的条带会出现引物二聚体，然后引物二聚体越来越严重，最后目的条带消失，出现涂抹带现象。本来认为是引物降解的原因，我合成了新的引物，也没有用。提取DNA我们使用的是索莱宝的动物基因组提取试剂盒，由于螨虫极小，所以提取的浓度只有不到3ng/μl，尝试了其他的提取方式但是都没有解决。但是在实验的前100虫体都很顺利，之后条带就逐渐消失。最后我直接重新设计了引物，扩增出来的条带及其明亮单一，用以前做不出来的DNA作为模板也是单一明亮的条带。由于重新设计了引物所以400个样本的检定又要重新开始，奇怪的地方又出现了，检定了一部分时之后又出现了同样的问题。之后我又设计了第三对引物，检定了一部分时之后同样的问题又出现了。
      总之只要我重新设计引物扩增条带就很好，但是使用一段时间后就不稳定了。就算重新合成新的引物也是如此，除非重新设计新序列的引物。

救救孩子，PCR做了半年了没结果


救救孩子，PCR做了半年了没结果-1


发自小木虫Android客户端
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
1楼 2022-02-23 16:17:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

拟南芥i

铁虫 (初入文坛)
引用回帖:
9楼: Originally posted by youentea25 at 2022-02-24 09:26:47
总觉得是模板降解了

如果是模板降解了的话，只要我重新设计引物，用以前的模板还是非常的亮和单一条带。这样一看也解释不通。

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
10楼2022-02-24 10:13:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 13 个回答

shuaibia6

金虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
你的引物是用什么稀释的，有没有尝试换水源
赞一下(5人) 回复此楼
2楼2022-02-23 16:58:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liugs

禁虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
本帖内容被屏蔽

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

拟南芥i
3楼2022-02-23 17:28:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pennchem

专家顾问 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
很有可能是每次扩增后电泳，导致实验室大量引物二聚体污染。

新引物可以正常扩增，但是随着电泳实验室引物二聚体越发严重，只能换新引物再来一次，如此循环。

可以考虑把出现问题的引物带到别的实验室去做，或者扩增后不电泳，放-20°C，等全部做完后，一次性电泳。
赞一下(8人) 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

拟南芥i
行至水穷处，坐看云起时
4楼2022-02-23 18:28:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 13 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 一志愿211，0860总分286食品工程专业求调剂 +5 林林Winnie 2026-03-05 5/250 2026-03-06 08:11 by 杨杨杨紫
[考研] 0856材料与化工求调剂！ +5 化工考生111 2026-03-04 11/550 2026-03-06 01:20 by 化工考生111
[考研] 化工282求调剂一志愿211 +5 NA0912 2026-03-05 6/300 2026-03-05 20:10 by 2735147993
[考研] 材料调剂 +5 ws 上岸鸭 2026-03-05 5/250 2026-03-05 20:06 by houyaoxu
[考研] 271求调剂 +7 月色c 2026-03-05 8/400 2026-03-05 19:51 by wangjihu
[考研] 中国科学技术大学材料与化工281求调剂，有科研和获奖经历 +11 wsxw 2026-03-02 12/600 2026-03-05 09:49 by oxidpl
[考研] 0856材料与化工，270求调剂 +17 YXCT 2026-03-01 20/1000 2026-03-05 09:22 by 一切OK
[考研] 320材料与化工，求调剂 +6 鹤遨予卿 2026-03-04 8/400 2026-03-04 20:47 by wutongshun
[考研] 一志愿西工大材料学，英一数二总分321分，求调剂。 +3 zz05zz 2026-03-02 5/250 2026-03-04 09:16 by lbsjt
[考研] 085600求调剂 +4 LRZZZZZZ 2026-03-02 6/300 2026-03-04 09:11 by 无际的草原
[考研] 289求调剂 +8 yang婷 2026-03-02 10/500 2026-03-04 09:10 by 无际的草原
[考研] 0703化学306调剂 +4 26要上岸 2026-03-03 4/200 2026-03-03 20:08 by yoyohj0427
[考研] 085602化学工程350，调剂，有没有211的 +5 利好利好. 2026-03-02 9/450 2026-03-03 17:06 by 利好利好.
[考研] 一志愿华中科技大学，化学专业344分，求调剂 +6 邢xing1 2026-03-02 6/300 2026-03-03 15:46 by stewie_jz
[考研] 一志愿中科大能动297求调剂，本科川大 +3 邵11 2026-03-03 3/150 2026-03-03 14:50 by 新能源达人
[考研] 321求调剂一志愿东北林业大学材料与化工英二数二 +5 虫虫虫虫虫7 2026-03-01 9/450 2026-03-02 21:33 by sunny81
[考研] 1 +5 2026计算机_诚心 2026-03-01 8/400 2026-03-02 11:05 by 汪！？！
[考研] 一志愿郑大材料学硕298分，求调剂 +6 wsl111 2026-03-01 6/300 2026-03-02 11:00 by ydudjddnd
[考研] 272求调剂 +6 田智友 2026-02-28 6/300 2026-03-01 21:40 by 公瑾逍遥
[考研] 311求调剂 +9 南迦720 2026-02-28 10/500 2026-03-01 10:55 by sunny81
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭