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payne木虫 (小有名气)
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【求助】在gromacs中计算capping的序列
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我在MOE中建立了一个N端乙酰化，C端酰胺化的蛋白质序列，可是在gromacs中pdb2gmx的时候就会出错，力场无法识别氨基。 我用的是gromos96 43a1力场。 有没有人能给一个正确的带有乙酰化和酰胺化的pdb文件，我照着改改pdb文件，估计可以解决。 [ Last edited by wuli8 on 2009-11-13 at 21:41 ] |
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payne
木虫 (小有名气)
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2楼2009-08-28 09:34:24