| 查看: 3637 | 回复: 6 | ||||
[求助]
MS中focite模块的能量计算 已有1人参与
|
请教MS中能量计算文本中valence(diag.term)与valence(cross term)的关系 发自小木虫Android客户端 |
回复此楼» 猜你喜欢
依托企业入选了国家启明计划青年人才。有无高校可以引进的。
已经有7人回复
-
遇见不省心的家人很难过
已经有24人回复
-
博士延得我，科研能力直往上蹿
已经有9人回复
-
天津大学招2026.09的博士生，欢迎大家推荐交流（博导是本人）
已经有6人回复
-
AI 太可怕了，写基金时，提出想法，直接生成的文字比自己想得深远，还有科学性
已经有6人回复
-
有院领导为了换新车，用横向课题经费买了俩车
已经有9人回复
-
酰胺脱乙酰基
已经有13人回复
-
同年申请2项不同项目，第1个项目里不写第2个项目的信息，可以吗
已经有4人回复
-
有时候真觉得大城市人没有县城人甚至个体户幸福
已经有10人回复
200204121
金虫 (正式写手)
- 应助: 4 (幼儿园)
- 金币: 1424.3
- 散金: 34
- 红花: 1
- 帖子: 425
- 在线: 279.5小时
- 虫号: 1119901
- 注册: 2010-10-11
- 专业: 聚合物共混与复合材料
|
没关系，你力场用的是COMPASS，它里面势函数包含三项，分别是化学键项，主要考虑键长，键角，扭转和二面角。能量交叉项和非键作用项主要考虑范德华力和静电作用。三项之和构成总势能。也即算出来的总能量 发自小木虫Android客户端 |
2楼2021-09-22 20:48:07
3楼2021-09-23 11:02:00
月只蓝
主管区长 (职业作家)
-
专家经验: +1059 - 模拟EPI: 1
- 应助: 1712 (讲师)
- 贵宾: 8.888
- 金币: 68124.7
- 散金: 1938
- 红花: 443
- 沙发: 4
- 帖子: 4373
- 在线: 3291.4小时
- 虫号: 1122189
- 注册: 2010-10-14
- 专业: 宇宙学
- 管辖: 计算模拟区
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
刘星雨0120: 金币+20, ★★★★★最佳答案 2021-09-23 11:07:02
感谢参与，应助指数 +1
刘星雨0120: 金币+20, ★★★★★最佳答案 2021-09-23 11:07:02
|
先正面回答楼主的问题，valence (diag.term)与valence (cross term)两者肯定是有密切关系的。为了理解这个问题需要先了解COMPASS力场能量的组成： 总能量=键能+非键能 （valence energy + non-bond energy） =键能对角项+键能交叉项+非键能 [ valence (diag.term) +valence (cross term) + non-bond energy ] 其中，键能对角项，又包括以下子项目： 1 Valence energy (diag. terms)：键能对角项 1.1 Bond：键长的伸缩 1.2 Angle：键角的弯曲 1.3 Torsion：二面角的扭转 1.4 Inversion（也称out-of-plane interactions）：离平面的弯曲 很好想象，对于一个分子而言，其中的键长、键角、二面角任一发生了变化，那必然引起其他项的变化，比如键角的弯曲，同时会引起键长、二面角的变化，反过来也一样。也就是说，分子中各种键能对角项的变化不是独立的，而是互相影响彼此的，这种互相影响的关系，即称之为交叉耦合（cross coupling）。由这种耦合贡献的能量项，被称之为键能交叉项（cross term，也称off-diagonal term）。 键能交叉项包含的子项目如下： 2 Valence energy (cross terms) [全称是 cross coupling terms]：键能中的交叉耦合项，简称键能交叉项 2.1 Stretch-Stretch：键长伸缩-键长伸缩两者的耦合 2.2 Stretch-Bend-Stretch：键长伸缩-键角弯曲-键长伸缩三者的耦合 2.3 Stretch-Torsion-Stretch：键长伸缩-二面角扭转-键长伸缩三者的耦合 2.4 Separated-Stretch-Stretch：独立的键长伸缩-键长伸缩三者的耦合 2.5 Torsion-Stretch：二面角扭转-键长伸缩两者的耦合 2.6 Bend-Bend：键角弯曲-键角弯曲两者的耦合 2.7 Torsion-Bend-Bend：二面角扭转-键角弯曲-键角弯曲三者的耦合 2.8 Bend-Torsion-Bend：键角弯曲-二面角扭转-键角弯曲三者的耦合 非键能包含的子项目如下： 3 Non-bond energy：非键能 3.1 van der Waals：范德华力能 3.2 Long range correction：范德华力能的长程修正项，适用于周期性模型，非周期性模型不含此项 3.3 Electrostatic：静电力能 |
4楼2021-09-23 11:06:41
5楼2021-09-23 11:10:35
ff1fanfan
新虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 167
- 散金: 5
- 帖子: 54
- 在线: 3.5小时
- 虫号: 33952620
- 注册: 2023-07-06
- 专业: 工程热物理相关交叉领域
6楼2024-04-12 21:05:26
ff1fanfan
新虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 167
- 散金: 5
- 帖子: 54
- 在线: 3.5小时
- 虫号: 33952620
- 注册: 2023-07-06
- 专业: 工程热物理相关交叉领域
7楼2024-04-12 21:09:35