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gwdavid木虫 (著名写手)
小木虫散兵坑坑长
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【求助】g_energy提取出来的静电项为什么比范德华项小这么多？
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我想用g_energy提取出来的能量项来计算结合自由能，但是我提取出来的coul项（coul-LR + coul-SR）为什么比范德华项（LJ-LR + LJ-SR）小这么多啊，差了一个数量级还多？我看文献上别人算的这两个能量项基本是差不多的，都应该在100多kj/mol以上是正常的。 注：体系是“蛋白质-配体”复合物在水溶液中，配体有带两个电荷的，有带一个电荷的，有不带电荷的，静电项都大约在这么多，模拟用的gromacs , NPT系综，静电力计算方法为cut-offs 先谢谢各位！ [ Last edited by lei0736 on 2009-11-24 at 20:56 ] |
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