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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » PCR污染或药品问题
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yuebanwan

金虫 (正式写手)

[交流] PCR污染或药品问题

1、在做转基因检测时，发现阴性对照及水也跑出条带来，开始以为是水的问题，换了还是存在；后来又以为是药品的问题，除了引物及酶都换了还是存在；后来，引物（743bp）也换了，还做了56、57、58。C三个温度，结果56是没有了，57、58还是有（且水的体系用的是早上56摄氏度时剩下的，中间间隔3~4h），何解？
         2、就是跑出来的，带也与预期的743bp大小不一样，大部分时候还在Marker的750bp带以上，为什么？
         3、有对引物（832bp）老是跑不出来，温度从54、55、56、57、58摄氏度五个梯度都P不出来，何故？
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学无止尽
1楼 2009-08-18 09:25:48
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liubing041

荣誉版主 (文坛精英)

忽忽家族之傻忽忽

优秀版主
★
yuebanwan(金币+5):谢谢参与
司马诸葛(金币+0,VIP+0):你路过的可真是时候啊！ 8-18 10:33
外行路过，友情帮顶
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“猫猫是谁？”....“还狗狗类...”
2楼2009-08-18 09:33:32
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xiaoyadxy

金虫 (小有名气)
★
yuebanwan(金币+5):谢谢参与
我在做转基因检测时，也遇到过同样的问题，我觉得可能是引物与基因组内错配，所以就也出来条带了。后来将我预期的目的条带测序验证就是我的那个基因。
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3楼2009-08-18 09:42:37
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司马诸葛
★
yuebanwan(金币+5):谢谢参与
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4楼2009-08-18 10:30:44
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傻子

木虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
yuebanwan(金币+5):谢谢参与
yuebanwan(金币+10,VIP+0): 8-21 16:10
1、在做转基因检测时，发现阴性对照及水也跑出条带来，开始以为是水的问题，换了还是存在；后来又以为是药品的问题，除了引物及酶都换了还是存在；后来，引物（743bp）也换了，还做了56、57、58。C三个温度，结果56是没有了，57、58还是有（且水的体系用的是早上56摄氏度时剩下的，中间间隔3~4h），何解？
--这个感觉是否是电泳上样有些问题，如果正常的话水是不会出现条带，上样小心样品飘出污染到旁边的孔，试试隔几个孔点，同时将电泳缓冲液更换新的，以前作出过什么都不加就有条带的电泳……另外对于PCR，不哟啊仅局限于调整退火温度，试试更换试剂等多种方法尝试实验后分析，我出现过dNTP 出问题检测了好久才找出来原因。或者重新合成引物，放久了也有失效的可能。
         2、就是跑出来的，带也与预期的743bp大小不一样，大部分时候还在Marker的750bp带以上，为什么？
--这个不好确定原因，自己出现过这样的，但不是说这样的就能认为是正常结果，建议将条带回收测序验证下。
         3、有对引物（832bp）老是跑不出来，温度从54、55、56、57、58摄氏度五个梯度都P不出来，何故？
--如果能保证试剂不出问题的话，试试再将退火温度降低，至45度左右，如果能出来，看条带是否有符合的，这时候非特异性条带会增多。如果不行，试试重新合成引物。
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1984年中国制造,长173CM,净重64kg,采用人工智能，国家免检优质产品。
5楼2009-08-18 10:36:21
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nql_sdau

银虫 (小有名气)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
司马诸葛(金币+2,VIP+0):鼓励新虫交流，给个红包 8-18 10:52
我以前阴性对照也能跑出带来！而且不加样的加样孔有时也有模糊的带！多次重做就好些啦！应该就是试验中的污染！
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6楼2009-08-18 10:37:34
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vivihao

金虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
帮顶，遇到同样情况，PCR阴性对照也跑出条带了。。。
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7楼2009-08-18 10:53:07
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rural2084

木虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
注意一下是不是用枪吸液体时吸得太多，导致液体污染枪杆。
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8楼2009-08-18 13:00:36
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yuebanwan

金虫 (正式写手)
自己顶起来。。
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学无止尽
9楼2009-08-18 16:23:17
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caoliang38

铁虫 (小有名气)
比较复杂 楼主能否再说的明白下
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10楼2009-08-18 16:49:38
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