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yuebanwan

金虫 (正式写手)

[交流] PCR污染或药品问题

1、在做转基因检测时,发现阴性对照及水也跑出条带来,开始以为是水的问题,换了还是存在;后来又以为是药品的问题,除了引物及酶都换了还是存在;后来,引物(743bp)也换了,还做了56、57、58。C三个温度,结果56是没有了,57、58还是有(且水的体系用的是早上56摄氏度时剩下的,中间间隔3~4h),何解?
         2、就是跑出来的,带也与预期的743bp大小不一样,大部分时候还在Marker的750bp带以上,为什么?
         3、有对引物(832bp)老是跑不出来,温度从54、55、56、57、58摄氏度五个梯度都P不出来,何故?
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学无止尽
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liubing041

荣誉版主 (文坛精英)

忽忽家族之傻忽忽

优秀版主


yuebanwan(金币+5):谢谢参与
司马诸葛(金币+0,VIP+0):你路过的可真是时候啊! 8-18 10:33
外行路过,友情帮顶
“猫猫是谁?”....“还狗狗类...”
2楼2009-08-18 09:33:32
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xiaoyadxy

金虫 (小有名气)


yuebanwan(金币+5):谢谢参与
我在做转基因检测时,也遇到过同样的问题,我觉得可能是引物与基因组内错配,所以就也出来条带了。后来将我预期的目的条带测序验证就是我的那个基因。
3楼2009-08-18 09:42:37
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yuebanwan(金币+5):谢谢参与
顶一下
4楼2009-08-18 10:30:44
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傻子

木虫 (正式写手)

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
yuebanwan(金币+5):谢谢参与
yuebanwan(金币+10,VIP+0): 8-21 16:10
1、在做转基因检测时,发现阴性对照及水也跑出条带来,开始以为是水的问题,换了还是存在;后来又以为是药品的问题,除了引物及酶都换了还是存在;后来,引物(743bp)也换了,还做了56、57、58。C三个温度,结果56是没有了,57、58还是有(且水的体系用的是早上56摄氏度时剩下的,中间间隔3~4h),何解?
--这个感觉是否是电泳上样有些问题,如果正常的话水是不会出现条带,上样小心样品飘出污染到旁边的孔,试试隔几个孔点,同时将电泳缓冲液更换新的,以前作出过什么都不加就有条带的电泳……另外对于PCR,不哟啊仅局限于调整退火温度,试试更换试剂等多种方法尝试实验后分析,我出现过dNTP 出问题检测了好久才找出来原因。或者重新合成引物,放久了也有失效的可能。
         2、就是跑出来的,带也与预期的743bp大小不一样,大部分时候还在Marker的750bp带以上,为什么?
--这个不好确定原因,自己出现过这样的,但不是说这样的就能认为是正常结果,建议将条带回收测序验证下。
         3、有对引物(832bp)老是跑不出来,温度从54、55、56、57、58摄氏度五个梯度都P不出来,何故?
--如果能保证试剂不出问题的话,试试再将退火温度降低,至45度左右,如果能出来,看条带是否有符合的,这时候非特异性条带会增多。如果不行,试试重新合成引物。
1984年中国制造,长173CM,净重64kg,采用人工智能,国家免检优质产品。
5楼2009-08-18 10:36:21
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nql_sdau

银虫 (小有名气)

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
司马诸葛(金币+2,VIP+0):鼓励新虫交流,给个红包 8-18 10:52
我以前阴性对照也能跑出带来!而且不加样的加样孔有时也有模糊的带!多次重做就好些啦!应该就是试验中的污染!
6楼2009-08-18 10:37:34
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vivihao

金虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
帮顶,遇到同样情况,PCR阴性对照也跑出条带了。。。
7楼2009-08-18 10:53:07
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rural2084

木虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
注意一下是不是用枪吸液体时吸得太多,导致液体污染枪杆。
8楼2009-08-18 13:00:36
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yuebanwan

金虫 (正式写手)

自己顶起来。。
学无止尽
9楼2009-08-18 16:23:17
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caoliang38

铁虫 (小有名气)

比较复杂 楼主能否再说的明白下
10楼2009-08-18 16:49:38
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