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小强2133

新虫 (初入文坛)

[求助] 质粒提取问题 已有1人参与

连载体,阳性验证,质粒不是环状吗?咋提出来是这种?求大佬帮忙分析下!

质粒提取问题


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原海亮

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
如果你是提取的质粒直接进行电泳,这样的电泳图是正常的,质粒本身是环状的结构,但在细胞环境内或者不同的生命周期里,常常存在质粒超螺旋的结构(比如在圆环的基础上,继续螺旋呈麻花状的超螺旋结构),而我们目前抽提质粒的方法,没办法保证质粒维持在一种结构,无论是物理剪切力还是试剂原因,都会导致质粒开环甚至成为线性的DNA。

       换句话讲,你抽提质粒后,其实里面有可能会出现质粒的两种到三种结构:超螺旋结构,开环结构,线性结构。而这三种不同的结构在进行琼脂糖电泳的时候,迁移速度是不一样的,导致一个质粒的胶图会出现两条带甚至三条带(迁移速度通常是:超螺旋>线性>开环)。

       楼主电泳目的是为了检测克隆阳性,那么简单的跑质粒是没有意义的(当然可以起到检测抽提质粒浓度的作用),重组载体真实大小的通常是看线性质粒的位置大小(开环或者超螺旋结构因为存在复杂的二级或者三级结构,其电泳迁移速度不仅仅是和片段大小相关,故不能真实反映片段长短),所以你如果需要通过提质粒筛选阳性克隆的话,是应该对质粒进行单酶切或者双酶切后,再进行电泳检测,这时候的结果才对筛选克隆有参考价值,祝好!
天空才是极限,我有信心飞的更高!
2楼2021-06-11 09:04:25
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