24小时热门版块排行榜

返回列表

当前主题已经存档。

zhaoliang_fly

金虫 (小有名气)

应助: 0 (幼儿园)
金币: 396.1
帖子: 135
在线: 67.2小时
虫号: 530268
注册: 2008-03-21
性别: GG
专业: 凝聚态物性I:结构、力学和

[交流] 【求助】关于分子动力学的几个初等问题

关于分子动力学的几个初等问题：
我原是物理专业的学生，考上研究生后老板叫我学习分子动力学模拟，可是我纯粹是新手，不知道从哪里开始啊，也不知道该看些哪些方面的东西。我就问几个初等的问题吧，希望高手给予解答：
（1）分子动力学和分子动力学模拟之间是什么关系啊？最初学习的时候有没有什么教材之类的？我一点基本概念都没有。。。。

（2）分子动力学和量子化学里的从头计算法是个什么关系啊？
（3）老板让我看gromacs,这和分子动力学模拟是什么关系啊？
谢谢高手解答啊！

[ Last edited by zdhlover on 2009-11-15 at 02:43 ]

回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

分子动力学

MD分子动力学

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

Molecular dynamics simulation!

1楼 2009-08-11 19:39:39

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

yalefield

金虫 (文坛精英)

老汉一枚

模拟EPI: 1
应助: 129 (高中生)
贵宾: 0.17
金币: 21238.9
散金: 3440
红花: 66
帖子: 12101
在线: 759.1小时
虫号: 96063
注册: 2005-10-07
专业: 高等教育学
管辖: 计算模拟

★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
lei0736(金币+4,VIP+0):谢谢 8-11 20:46

（1）分子动力学是分子动力学模拟的简称
（2）陈正隆的书，找来看看
（3）分子动力学，一般不考虑电子，这是与量子化学的最大区别。
（4）如果说分子动力学是粥，GROMACS就是勺。

赞一下(11人)

回复此楼

2楼2009-08-11 20:36:24

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

043114076

木虫 (正式写手)

应助: 49 (小学生)
金币: 3364.9
散金: 52
红花: 23
帖子: 788
在线: 369.5小时
虫号: 570592
注册: 2008-06-07
性别: GG
专业: 理论和计算化学

★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
lei0736(金币+4,VIP+0):谢谢 8-11 22:07

首先，最简单的办法是上google搜索。另外将本站以前的帖子浏览一下，也应该得到你想要的结果。
然后回答你的问题。以下纯粹是我个人的理解，仅供讨论。
1，分子动力学与分子动力学模拟应该是一个意思，具体概念如下：（来自维基百科）：
分子动力学是一套分子模拟方法，该方法主要是依靠牛顿力学来模拟分子体系的运动，以在由分子体系的不同状态构成的系综中抽取样本，从而计算体系的构型积分，并以构型积分的结果为基础进一步计算体系的热力学量和其他宏观性质。
参考书籍，我最初看的有：分子模拟－－从算法到应用，分子模拟的理论与实践。网上都很容易搞到，图书馆一般都有。
2，分子动力学模拟与量子化学计算的理论基础是完全不同的。前者是以牛顿力学为基础，量化计算以现代量子力学为基础。
两者所面对的对象不同，但也不是没有联系。我现在看的一个叫做从头算的分子动力学（ab initio molecular dynamics,简称AIMD），就是将两者结合起来。具体的内容自己上网看。
3，gromacs我没有用过，可能象gaussian一样，是一个计算软件。

赞一下(11人)

回复此楼

3楼2009-08-11 20:55:28

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖