应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 【求助】autodock受体文件
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
51/1返回列表
查看: 611  |  回复: 4
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前主题已经存档。

taizf

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助】autodock受体文件

请教个问题 看到好多文献都是从complex来准备受体文件 我想知道没有complex 或者有个complex但是它的配体是蛋白质  应该怎么处理，怎么定义活性位点

初学autodock大家不要笑话 先谢谢了

[ Last edited by lei0736 on 2009-11-24 at 21:23 ]
回复此楼

» 猜你喜欢
1楼 2009-08-10 18:17:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

guoyingnba

金虫 (小有名气)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
yjcmwgk(金币+2,VIP+0):感谢交流 8-12 10:05
taizf(金币+10,VIP+0):十分感谢您的回复 我想详细请教下，可不可以给我个邮箱或者qq 8-12 11:48
没有复合物晶体结构的话那你就要参考文献中的关键位点了，另外你也可以把整个蛋白包在box中用已知的配体进行搜索，找出活性位点。怎么定义活性位点的话还是应当仔细研究蛋白的功能和再考虑你的目的是什么。
赞一下(8人) 回复此楼
2楼2009-08-12 09:17:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

guoyingnba

金虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by guoyingnba at 2009-8-12 09:17:
没有复合物晶体结构的话那你就要参考文献中的关键位点了，另外你也可以把整个蛋白包在box中用已知的配体进行搜索，找出活性位点。怎么定义活性位点的话还是应当仔细研究蛋白的功能和再考虑你的目的是什么。

我的QQ是46483182
赞一下(1人) 回复此楼
3楼2009-08-13 13:53:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

一步一步

木虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by guoyingnba at 2009-8-12 09:17:
没有复合物晶体结构的话那你就要参考文献中的关键位点了，另外你也可以把整个蛋白包在box中用已知的配体进行搜索，找出活性位点。怎么定义活性位点的话还是应当仔细研究蛋白的功能和再考虑你的目的是什么。

我想知道在Sybyl中可否把整个蛋白包在box中用已知的配体进行搜索，找出活性位点？？应该用哪些命令？？
赞一下(1人) 回复此楼
4楼2009-09-29 16:51:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gwdavid

木虫 (著名写手)

小木虫散兵坑坑长
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 12-30 22:15
都可以的，sybyl,insightII,autodock都有活性位点搜索，具体的可以参考相关的教程。一般这个菜单是active site search
赞一下(11人) 回复此楼
个人博客：[url]http://blog.sina.com.cn/gaiwei[/url]
5楼2009-09-29 16:55:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 taizf 的主题更新
51/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 081700，311，求调剂 +16 冬十三 2026-04-04 17/850 2026-04-06 14:56 by 尚水阁主
[考研] 070300化学279求调剂 +16 哈哈哈^_^ 2026-03-31 19/950 2026-04-06 14:14 by 无际的草原
[考研] 求调剂，一志愿厦门大学，生物与医药，总分272，本科211 +4 Electron1cc 2026-04-01 5/250 2026-04-06 10:45 by barlinike
[考研] 070300化学学硕311分求调剂 +11 梁富贵险中求 2026-04-04 13/650 2026-04-06 07:24 by houyaoxu
[考研] 一志愿211，化学学硕，310分，本科重点双非，求调剂 +13 努力奋斗112 2026-04-04 13/650 2026-04-06 07:13 by jj987
[考研] 考研调剂 +6 15615482637 2026-04-04 6/300 2026-04-04 22:43 by yu221
[考研] 求调剂 +3 ffyyu 2026-04-02 3/150 2026-04-04 19:03 by 蓝云思雨
[考研] 0710生物学336分求调剂 +6 kiyy 2026-04-01 8/400 2026-04-04 10:10 by kiyy
[考研] 考研调剂 +3 15615482637 2026-04-03 3/150 2026-04-03 22:50 by ms629
[考研] 286求调剂 +8 lim0922 2026-04-02 8/400 2026-04-03 20:19 by rzh123456
[考研] 372分材料与化工（085600）一志愿湖南大学求调剂 +3 蓝笺片 2026-04-03 4/200 2026-04-03 17:58 by Jimmyandyou
[考研] 专硕085601求调剂 +7 suyifei 2026-04-03 8/400 2026-04-03 14:00 by 欣喜777
[考研] 求调剂 +9 akdhjs 2026-03-31 11/550 2026-04-03 13:32 by akdhjs
[考研] 建环，能源，土木老师路过看一看！！！ +5 嘿嘿uu 2026-04-01 5/250 2026-04-03 11:47 by znian
[考研] 303求调剂 +3 一色清羽 2026-04-02 4/200 2026-04-03 10:22 by 蓝云思雨
[考研] 271求调剂 +15 勒布朗@ 2026-03-31 20/1000 2026-04-02 11:24 by Sammy2
[考研] 085602化学工程268分蹲调剂 +8 月照花林。 2026-04-01 8/400 2026-04-01 22:08 by 无际的草原
[考研] 353求调剂 +4 拉钩不许变 2026-04-01 4/200 2026-04-01 18:10 by 记事本2026
[考研] 262求调剂 +9 励志一定发文章 2026-03-31 10/500 2026-04-01 12:22 by sunshine0013
[考研] 【调剂】一志愿厦大生物与医药调剂 +3 Echo虾米 2026-03-31 3/150 2026-04-01 08:40 by JourneyLucky
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭