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我想问一下重新组装基因组要怎么弄
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如果想要重新组装一个物种的基因组，因为参考基因组和我的品种之间差异比较大，想重新组装基因组，那都需要采用什么测序方法，测多少X， @starseacow 发自小木虫Android客户端 |
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xiaowoodworm
金虫 (正式写手)
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不知道你想研究的是啥物种，测序方法是de novo测序（从头测序）主要针对基因组序列未知或参考基因组组装不理想的物种，构建不同类型的基因组DNA文库，并进行序列测定。然后使用生物信息学方法对序列进行拼接、组装和注释，从而绘制该物种完整的基因组序列信息。简单基因组：重复序列低于50%，且二倍体杂合度低于0.5%的物种。 复杂基因组：重复序列高于50%，或二倍体杂合度高于0.5%，或其他多倍体物种。至于测多少×，还跟你研究的物种的基因组大小，重复序列，杂合度等有关，三代测序也可以测，上海派森诺生物可以做。 发自小木虫Android客户端 |
2楼2021-04-22 17:31:14