24小时热门版块排行榜    

查看: 2572  |  回复: 11
【悬赏金币】回答本帖问题,作者ljmmarise将赠送您 300 个金币
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

ljmmarise

至尊木虫 (著名写手)

[求助] 电荷不平衡、游离水上加质子晶体解析求助 已有1人参与

有一个晶体数据,可以解析出结构,但是电荷不平衡。配体是负三价,金属是+2价。解析过程中,不对称单元中有六分之一的配体,六分之一的金属,即负电荷-1/2,而正电荷+1/3,还缺少正电荷+1/6。试图把+1/6正电荷以质子的形式加到游离水上,但是不知道如何处理?请告诉如何处理这个电荷不平衡的问题,还是一开始的解析有错误呢?高手请出手。

晶体数据文件链接: https://pan.baidu.com/s/1sw1gegm4kn_sxjksri8l1g 提取码: v6h5
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ljmmarise

至尊木虫 (著名写手)

送红花一朵
引用回帖:
9楼: Originally posted by mfdsrax2 at 2021-04-21 22:21:28
给四唑上加个氢,指定1/6的占有率就行,问题是这个数据里面四唑没有多余位点了,两个与Cd配位,两个与水形成氢键,这个想处理好就比较麻烦。其实就这样问题也不大,你知道有一个四唑上还有氢原子就行...

确实是这样的情况。还有一个情况就是,也可以在游离水分子周围找一个Q峰,定为质子H,指定占有率为1/6。按理质子应该是在四氮唑上,N碱性强。但一grow,没配位的四氮唑上N,都有质子氢。

发自小木虫Android客户端
10楼2021-04-22 00:04:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 12 个回答

mfdsrax2

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
提示页面不存在,再确认下链接有没有错
2楼2021-04-21 14:33:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ljmmarise

至尊木虫 (著名写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by mfdsrax2 at 2021-04-21 14:33:17
提示页面不存在,再确认下链接有没有错

链接: https://pan.baidu.com/s/1xOC5CdlaLofeIWC6Q2-BOA 提取码: xa37
3楼2021-04-21 19:15:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ljmmarise

至尊木虫 (著名写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by mfdsrax2 at 2021-04-21 14:33:17
提示页面不存在,再确认下链接有没有错

谢谢您,现在我把原始文件,和我解析的结构,配体的结构都打包上传了,多谢您的帮助。
4楼2021-04-21 19:17:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
不应助 确定回帖应助 (注意:应助才可能被奖励,但不允许灌水,必须填写15个字符以上)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] FileCode能看出啥? +8 要乐观耀哥 2026-08-10 26/1300 2026-08-13 12:01 by Tide man
[基金申请] 重要来源:本周末出结果 +9 瞬息宇宙 2026-08-12 9/450 2026-08-13 10:12 by Vivilian
[基金申请] 结合人工智能,周易传统文化,filecode打分制来了,3分以上希望很大。 +3 Tide man 2026-08-12 4/200 2026-08-13 08:35 by ZJTJZ
[基金申请] 2019年青年基金涵评意见,大家看看几个A,几个B? +11 Tide man 2026-08-11 11/550 2026-08-13 07:35 by 撸猫猫
[基金申请] 应该是93bebmhtak前后十一个字符比较关键 +22 Lanmanbaby 2026-08-09 36/1800 2026-08-12 22:50 by sdfapple719
[基金申请] filecode +13 documentary 2026-08-10 15/750 2026-08-12 15:56 by 云上清扬
[论文投稿] 职称评审,求友友推荐见刊最快的期刊 +4 工厂打螺丝 2026-08-08 4/200 2026-08-12 09:18 by hansi2025
[基金申请] 奇怪,两个人的filecode固定段从头到尾一模一样 +7 布布和一二 2026-08-10 10/500 2026-08-12 09:12 by 布布和一二
[基金申请] 是这周出结果还是下周出结果? +3 yuleib84 2026-08-11 3/150 2026-08-11 21:53 by jnhyjjm
[基金申请] 帮忙看看fileCode +7 wwncly 2026-08-10 13/650 2026-08-11 19:36 by 冰心玉壶晴
[硕博家园] 读博的好处 +3 lnee 2026-08-11 3/150 2026-08-11 18:10 by 希望我好好的
[基金申请] 什么时候出结果,有咨询渠道??? +3 Tide man 2026-08-11 3/150 2026-08-11 17:54 by kudofaye
[基金申请] 分享一下我之前已中青C的计划书的filecode +3 布布和一二 2026-08-11 4/200 2026-08-11 15:20 by aasahr
[基金申请] 听说今天filecode变了 +26 布布和一二 2026-08-06 49/2450 2026-08-11 13:18 by WH3796
[基金申请] 据悉今年马上要出结果了 +7 瞬息宇宙 2026-08-10 8/400 2026-08-10 12:42 by Vivilian
[基金申请] 2026国自然放榜时间 +9 布布和一二 2026-08-08 9/450 2026-08-10 11:22 by xxxx2020
[基金申请] 面上项目filecode邪修 +5 西山十月 2026-08-09 7/350 2026-08-10 07:32 by 仁砚薪传
[基金申请] filecode与中标关系的预测 +5 布布和一二 2026-08-07 5/250 2026-08-09 16:15 by 袁向阳007
[基金申请] fileCode有新解读? +10 Tide man 2026-08-08 18/900 2026-08-09 12:55 by 仁砚薪传
[基金申请] 关于filecode,很负责任的告诉大家 +6 爱看书的可乐 2026-08-08 7/350 2026-08-08 22:13 by a_niu
信息提示
请填处理意见