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PCR点突变质粒相关疑问
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我现在在做单点突变的质粒,是利用PCR去实现的。 现在有两种做法: 1.直接上下游设计引物,上游为突变位点三个碱基带两边各15bp,下游为突变位点前30bp。primestar 的fastpfu使用,以质粒或者菌液为模板去扩增。然后直接往商用感受态转化.整体载体使用的是pet30a带T7启动子终止子,共6000多bp,目的片段为1176bp。95 5 95 18s 55 18s 72 3.30m。 2.第二,按照之前的体系,但单独加入单引物进行单引物pcr,加入的质粒小于50ng,后加入dpn I消化一小时。后混合,94 10m ,37 40m孵育。 使用的抗性为卡那抗性。 想问的有三个问题: 1.这样的方法是否存在原模板未消化干净之外的假阳性? 2.方法一会产生部分无法自连的两段带有引物同源片段的长链,约6000bp也是,这个转入后是否会产生抗性? 3.菌落pcr有时能做出,有时候不能,是否做不出来就代表是假阳性?有的之前做出来了测序有结果是对的,挑取后摇起来,菌液直接做pcr结果没结果。送菌液或者自己提取质粒后送测序是否更好? 4.这个质粒能在菌里大概保存几代?不会我今天测序,明天挑了摇起来就没有了吧。摇起来后能否就用摇起来的菌再传代提质粒 ? |
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