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uehchdh

铁虫 (初入文坛)

[交流] 求助CIF转SMILES

请问,有了晶体的CIF文件,怎样可以得到对应的SMILES表示啊?
我是计算机专业的跨领域,对晶体学才刚接触,求大神指点
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温ming

木虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
cif文件里面就是纯文本,包含了晶体的化学式和晶体结构。
smiles是表示分子式,应该无法表达晶体的结构。
如果是想批量处理cif文件成smiles式,还是有点复杂的,因为要从cif里面分析出来合适的分子式。
可以尝试从cif里面分析出原胞,再按照连接关系转成smiles
有事先百度
2楼2021-03-24 13:44:57
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