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铁虫 (初入文坛)

[交流] 求助CIF转SMILES

请问，有了晶体的CIF文件，怎样可以得到对应的SMILES表示啊？
我是计算机专业的跨领域，对晶体学才刚接触，求大神指点

1楼 2021-03-23 10:38:12

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木虫 (正式写手)

★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖

cif文件里面就是纯文本，包含了晶体的化学式和晶体结构。
smiles是表示分子式，应该无法表达晶体的结构。
如果是想批量处理cif文件成smiles式，还是有点复杂的，因为要从cif里面分析出来合适的分子式。
可以尝试从cif里面分析出原胞，再按照连接关系转成smiles

有事先百度

2楼2021-03-24 13:44:57

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