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sculhf

荣誉版主 (知名作家)

断翼天使

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[交流] 【求助】如何计算前线分子轨道电荷密度?

What charge density values corespond to the iso-surfaces?
请教如何计算分子轨道电荷密度?
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谋事在人成事在天
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recoli

金虫 (正式写手)

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 8-2 13:31
引用回帖:
Originally posted by sculhf at 2009-8-1 13:30:

我觉得评审人的意思应该是电子密度而不是电荷密度
你认为呢?
电子密度是定义各个轨道上分布的电子数,通常的密度矩阵就是表达这个的。
而电荷密度,表示原子上有多少净电荷。
电子密度针对轨道,电荷密度针 ...

审稿人的问题要看上下文的,这个只有你自己知道了。但既然提到了iso-surface和前线轨道,那么我猜审稿人是在问HOMO/LUMO的isovalue值。这个值在GaussView里是可调的,调小了轨道看起来就比较弥散,调大了轨道看起来就比较紧凑。
7楼2009-08-01 15:12:29
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recoli

金虫 (正式写手)

★ ★ ★
sculhf(金币+1,VIP+0):iso-value是0.02 这里的0.02是电荷密度吗?单位是什么?谢谢 7-31 22:37
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 8-2 13:30
这是审稿人的问题吗?如果是的话,这个iso-value在用GaussView画图的时候就有显示,注意看一下那个小窗口。HOMO/LUMO图的默认iso-value是0.02,电荷密度的话你再看一下。
2楼2009-07-31 22:24:28
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recoli

金虫 (正式写手)

★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 8-2 13:30
文献里写单位是a.u.。具体应该是电子电荷除以波尔半径的三次方。
3楼2009-07-31 23:12:41
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zhou2009

版主 (著名写手)

★ ★ ★ ★ ★ ★
sculhf(金币+1,VIP+0):谢谢 8-1 13:21
lei0736(金币+5,VIP+0):谢谢 8-2 13:30
G03的cubegen不能作某个MO的ρ,将某个MO的cube输入到cubman也不能作平方运算作成ρ,因为cubman缺少平方运算。

    这时,可以运行cubegen,回答:
Property [Density]? HOMO(或者LUMO)
即得到HOMO的空间格点文件。

    将此文件进入gsgrid程序,对这格点数据进行平方,再乘以2(两个电子占据这个轨道时),即得到该MO的电子密度。然后再进入绘图程序作图。
    进入gsgrid程序时,最好先选择一个该MO的最有代表性的截面,再作平方等,这样可以用sigmaplot作出该MO电子密度的等值线来。

    但是由于电子密度是MO的平方,是没有了相位的,讨论前线分子轨道问题,还是要看HOMO、LUMO,特别是看它们的对称性、相位是否相符。
4楼2009-08-01 09:15:34
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