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Gsjsh

新虫 (初入文坛)

[求助] 构建过表达载体,基因CDS大片段缺失 已有2人参与

大家好,我最近想构建一个基因的过表达载体。从CDS中PCR该基因(3100bp),条带单一,大小正确,回收的基因片段测通,序列正确。但是我用同源重组的方式,将基因片段连接到慢病毒载体上,转化后酶切验证,发现插入片段只有1000bp左右,测序也发现中间有2000多bp 的缺失。后面想到可能发生了细菌重组,从原来的DH5a感受态改为用Stbl3和Stable感受态,但是酶切结果显示插入片段还是只有不到1000bp。后来直接把胶回的基因片段连到T载体上,用Stbl3和Stable感受态转化,依然发现插入片段大范围缺失。

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木元雨

木虫 (职业作家)

你查查你的基因里有没有这个酶切位点

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2楼2021-02-01 00:49:00
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kangaroo0513

新虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
我也遇到过类似的事情,当时我们做的是APOE基因,PCR结果很好,插入片段均有缺失(缺失的位置有几种,且可重复)。这个我们最后只能通过密码子优化用大量同义突变进行替换,最终完成克隆。so,也推荐你这么试试。你玩的是哪个苦逼的基因啊?
3楼2021-02-01 08:00:52
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孟安格

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
酶切回收过程中,电泳时你的插入片段大小对应的上吗?是1000bp还是3000bp?
4楼2021-02-03 16:33:51
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