24小时热门版块排行榜    

查看: 2503  |  回复: 6
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

JZZ3090

新虫 (初入文坛)

[求助] 请教rescue experiment 统计学方法 已有1人参与

最近做了x基因敲除的细胞系,然后在这个细胞系中瞬时表达GFP-x基因,同时检测某表型是否回归正常水平,也就是rescue experiment(不知道中文叫什么,援救实验吗?),现在在做显著性分析,对统计方法产生了疑问。

我设计了三组实验并对其表型进行了定量
1,对照组细胞(无敲除)表达GFP,
2,x基因敲除细胞系表达GFP,
3,x基因敲除细胞系表达GFP-x基因
我需要对比三组数据的表型,即,检验第二组与第一组有是否显著差异,第三组与第二组是否有显著差异,以及第三组是否回归到第一组的水平。

我应该用哪种统计方法进行显著差异分析?
是否应该将三组数据拆成两两一组,分别进行mann whitney test(数据不符合正态分布),还是应该选择其他检验方法?
我也考虑了kruskal-wallis test和two-way ANOVA
kruskal-wallis的问题是,我的数据中,表型受两种因素影响(细胞系和表达的基因),并非单因素分析
用two-way ANOVA的话,缺少了一组【对照组细胞表达GFP-x】的数据,无法进行分析,而且我觉得这组数据对实验结论没有影响

不知道有没有对统计学比较了解的或者做过此类实验的人能帮忙解答一下我的问题。
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

JZZ3090

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by fuyuandj86 at 2021-01-31 22:43:49
"检验第二组与第一组有是否显著差异,第三组与第二组是否有显著差异,以及第三组是否回归到第一组的水平"
就按照这个做三次t检验就好了,不用搞那么复杂

谢谢解答,因为金币不够所以没能及时回复。。。
请问第一组与第三组比较也可以用t检验吗?细胞系和表达的基因都不一样。
3楼2021-02-02 10:02:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答

fuyuandj86

版主 (著名写手)

己所不欲,勿施于人

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
"检验第二组与第一组有是否显著差异,第三组与第二组是否有显著差异,以及第三组是否回归到第一组的水平"
就按照这个做三次t检验就好了,不用搞那么复杂
The doer of good becomes good, the doer of evil becomes evil.
2楼2021-01-31 22:43:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fuyuandj86

版主 (著名写手)

己所不欲,勿施于人

【答案】应助回帖

第一组和第三组比较确实不够严谨,这个得看审稿人对于数据的严谨性要求有多严格了。
如果对照组是一个敲除对照会好一些,也就是说对照组也转了Cas9和一个不能针对任何基因的sgRNA。
当然还有一种策略是用siRNA敲低,对照组转一个不能针对任何基因的对照siRNA。这样就保证了三组都用同一个细胞系。
The doer of good becomes good, the doer of evil becomes evil.
4楼2021-02-02 10:19:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

JZZ3090

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by fuyuandj86 at 2021-02-02 10:19:21
第一组和第三组比较确实不够严谨,这个得看审稿人对于数据的严谨性要求有多严格了。
如果对照组是一个敲除对照会好一些,也就是说对照组也转了Cas9和一个不能针对任何基因的sgRNA。
当然还有一种策略是用siRNA敲低 ...

谢谢您的回复。
siRNA的策略确实做了,但由于一些原因放弃了这个方法,所以在用Cas9做。
比较麻烦的是没有时间再做对照细胞系了,所以想找一个合适的统计方法。
请问,不对比第一组和第三组,只对比第二组与第一组,和第二组与第三组的数据,如果都有显著性差异是否能说明结论?
5楼2021-02-02 14:14:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 科研人应该花精力去思考如何解决问题,而不是去凝练问题 +5 瞬息宇宙 2026-09-01 11/550 2026-09-02 14:15 by simwe390
[基金申请] 要骂人了,新模版改版就是要淡化问题凝练这种虚的东西,结果有个评委还在说凝练得不够 +9 瞬息宇宙 2026-08-31 17/850 2026-09-02 14:04 by anjeeshine
[基金申请] 基金系统什么内容也没有 30+4 winsaint 2026-08-27 10/500 2026-09-02 11:35 by 大不刘6
[基金申请] 学科评审组评审是指会评吗? +5 瞬息宇宙 2026-08-31 5/250 2026-09-02 10:13 by 雨冰共舞
[文学芳草园] 梦想 +5 myrtle 2026-08-26 8/400 2026-09-02 02:42 by Leogzhya
[基金申请] 面上合作单位盖章 +6 ssyjh 2026-08-27 9/450 2026-09-01 20:01 by huagongfeihu
[基金申请] 面上函评意见出来了,像什么等级? 20+4 Tsingking1 2026-08-27 17/850 2026-09-01 19:51 by 超级无敌华子
[基金申请] 为什么资助数各大高校都创新高,自己申请怎么就这么难 +13 Kittylucky 2026-08-27 14/700 2026-09-01 11:06 by feng6531
[论文投稿] 小白求助 投论文要求的highlights应该如何写 5+3 l1963982152 2026-08-29 4/200 2026-09-01 09:04 by 北京莱茵编辑
[基金申请] 麻烦专家们看看评委们的意见(F口面上) +7 gdd2018 2026-08-28 12/600 2026-09-01 08:32 by 尼古拉斯小虫
[基金申请] 面上意见出来了 +12 黄鸟于飞Chao 2026-08-29 23/1150 2026-08-31 18:57 by 黄鸟于飞Chao
[基金申请] 能否申诉? +7 echo8914667 2026-08-30 8/400 2026-08-31 17:00 by yihongxu
[基金申请] 中青基了要发朋友圈吗? +7 349506619 2026-08-28 7/350 2026-08-31 13:39 by 冼亮淀粉酶
[基金申请] 29号明天会评吗 +4 笨笨唐 2026-08-28 4/200 2026-08-31 09:30 by huixian257
[基金申请] 为什么到现在没收到通知? +5 tannykie 2026-08-29 5/250 2026-08-30 21:05 by purplejack
[考博] 找导师 +6 yuanjiabao 2026-08-29 7/350 2026-08-30 14:40 by 生科新手
[基金申请] 我就是申请一个面上项目而已,这评审意见是按照杰青的条件评的吧? +6 gouxfjh 2026-08-28 11/550 2026-08-30 07:57 by gouxfjh
[基金申请] 国自然评审意见 +13 wangmingqi 2026-08-28 19/950 2026-08-29 10:22 by Poppy1104
[基金申请] 2026年叶企孙基金 +4 bud_bud 2026-08-27 7/350 2026-08-29 07:23 by foolishmani
[基金申请] 看板上这么多中的,有点像50人群里49个人都是骗子的那种感觉…… +5 a089 2026-08-26 6/300 2026-08-27 14:05 by jonewore
信息提示
请填处理意见