24小时热门版块排行榜    

CyRhmU.jpeg
查看: 2987  |  回复: 2
【悬赏金币】回答本帖问题,作者卧胜于坐将赠送您 88 个金币

卧胜于坐

新虫 (小有名气)

[求助] HMMER软件hmmsearch报错无法打开序列Failed to open sequence file怎么办已有2人参与

用hmmer对拟南芥蛋白某家族构建了隐马尔可夫模型hmm文件,然后下载了目标物种的蛋白序列文件,运行
> .\hmmsearch 基因名.hmm 文件名.fa>基因名.out

结果报告:
Failed to open sequence file 文件名.fa>基因名.out for reading

无法生成.out文件
fa后缀换成fasta不行,下载了embl格式的txt也不行,哭了
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

灵素古今

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

内容已删除
2楼2020-12-30 13:35:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gaoyang636

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

肯定不是后缀名的问题,你把这个fa文件拖进记事本里看看什么样子?最好截个图发上来。

如果文件太大,记事本打开会有困难。那就下载一个ultraEdit或者gVIM打开
3楼2021-01-05 10:17:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 卧胜于坐 的主题更新
不应助 确定回帖应助 (注意:应助才可能被奖励,但不允许灌水,必须填写15个字符以上)
信息提示
请填处理意见