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bright8

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[求助] 如何提取转录组中比对上的500多序列及比对参数信息

转录组中测序的unigene序列，与本地建立linux系统建立的数据进行blast比对，如何导出比对后匹配上的转录组序列？有500多条？求大神指点？有没有什么程序或代码，可全部导出。

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1楼 2020-11-21 09:47:34

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JY_Lee

新虫 (初入文坛)

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blast输出的结果里面有比对上的序列的id和范围的，写个脚本从原来的数据里面提取就可以了

发自小木虫Android客户端

2楼2020-11-21 21:30:09

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bright8

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同问，问题解决了吗？脚本可以分享吗？

3楼2021-03-11 11:03:06

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xuannnn

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偏个楼，请问楼主测序的unigene序列的编号是自己编号的吗？编号有没有什么依据呢？（纯小白，求指教）

4楼2021-09-26 16:11:52

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